More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0908 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  100 
 
 		 472 aa  965    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  65.61 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  60.87 
 
 		 468 aa  556  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  46.2 
 
 		 471 aa  411  1e-113  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  43.95 
 
 		 467 aa  394  1e-108  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  44.73 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  43.58 
 
 		 473 aa  387  1e-106  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  41.51 
 
 		 469 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  40.04 
 
 		 470 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  40.46 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  40.88 
 
 		 468 aa  332  8e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  40.46 
 
 		 468 aa  330  4e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  39.75 
 
 		 469 aa  329  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  39.75 
 
 		 469 aa  329  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  40.54 
 
 		 467 aa  329  8e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  40.88 
 
 		 468 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  40.46 
 
 		 468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  40.46 
 
 		 468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  40.46 
 
 		 468 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  40.46 
 
 		 468 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  38.19 
 
 		 469 aa  323  5e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  36.29 
 
 		 476 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  37.79 
 
 		 465 aa  294  3e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  37.15 
 
 		 465 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  36.29 
 
 		 467 aa  290  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  37.34 
 
 		 464 aa  288  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  37.53 
 
 		 464 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  35.47 
 
 		 470 aa  265  2e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  36.02 
 
 		 464 aa  253  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.5 
 
 		 345 aa  248  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  37.15 
 
 		 465 aa  246  8e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  33.97 
 
 		 463 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  33.55 
 
 		 481 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  36.9 
 
 		 444 aa  217  4e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  33.48 
 
 		 473 aa  209  1e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  26.92 
 
 		 438 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  30.48 
 
 		 449 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  30.39 
 
 		 481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  30.25 
 
 		 576 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  30.37 
 
 		 450 aa  169  8e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  30.39 
 
 		 575 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  29.83 
 
 		 576 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  28.57 
 
 		 579 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  28.94 
 
 		 484 aa  160  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  30.2 
 
 		 576 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  30 
 
 		 576 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  28.54 
 
 		 592 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  29.5 
 
 		 576 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  29.57 
 
 		 585 aa  156  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  28.47 
 
 		 504 aa  144  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  30.07 
 
 		 579 aa  144  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  28.24 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  29.17 
 
 		 579 aa  141  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  24.84 
 
 		 591 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  28.88 
 
 		 525 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  28.12 
 
 		 534 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  27.59 
 
 		 508 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  28.27 
 
 		 578 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.52 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  26.3 
 
 		 533 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  26.07 
 
 		 533 aa  117  5e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  26.07 
 
 		 533 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  24.9 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  24.75 
 
 		 547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  23.81 
 
 		 456 aa  114  5e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  24.75 
 
 		 547 aa  113  9e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  45.88 
 
 		 108 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  26.6 
 
 		 280 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  32.2 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  32.2 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  48.65 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  41.38 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  41.38 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  39.76 
 
 		 512 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  31.88 
 
 		 406 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.2 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  31.88 
 
 		 406 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  37.86 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2938  acetylornithine deacetylase  31.07 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  28.57 
 
 		 474 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  28.78 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  51.67 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  31.22 
 
 		 397 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  30.9 
 
 		 469 aa  63.9  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.8 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  32.74 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1445  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.38 
 
 		 365 aa  63.5  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0181667  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2132  peptidase M20  32.1 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.232525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  28.29 
 
 		 426 aa  63.5  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0720  peptidase M20  30.47 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.611917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  32.3 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.33 
 
 		 366 aa  63.2  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  34 
 
 		 404 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  30.69 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2287  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  37.5 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  39.42 
 
 		 405 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  27.32 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3476  peptidase family M20/M25/M40 domain-containing protein  30.68 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.128443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>