More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0420 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  100 
 
 		 449 aa  912    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  52 
 
 		 450 aa  506  9.999999999999999e-143  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.48 
 
 		 457 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  34.35 
 
 		 444 aa  266  7e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  35.67 
 
 		 465 aa  249  8e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  33.91 
 
 		 464 aa  241  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  36.77 
 
 		 465 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  34.37 
 
 		 467 aa  229  8e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  32.89 
 
 		 464 aa  226  4e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  34.97 
 
 		 465 aa  225  1e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  34.39 
 
 		 464 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  32.85 
 
 		 470 aa  222  9e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  30.74 
 
 		 469 aa  215  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  33.33 
 
 		 467 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  30.11 
 
 		 469 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  31.66 
 
 		 468 aa  212  1e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  30.23 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  30.23 
 
 		 469 aa  211  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  32.48 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  31.65 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  31.79 
 
 		 468 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  32.06 
 
 		 468 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  30.6 
 
 		 463 aa  206  6e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  32.27 
 
 		 468 aa  206  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  31.49 
 
 		 468 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  31.49 
 
 		 468 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  31.7 
 
 		 468 aa  202  7e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  31.83 
 
 		 467 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  31.8 
 
 		 470 aa  197  2.0000000000000003e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  31.47 
 
 		 473 aa  193  5e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  31.53 
 
 		 468 aa  192  9e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  31.06 
 
 		 465 aa  192  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  31.37 
 
 		 476 aa  186  6e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  30.67 
 
 		 471 aa  186  8e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  30.48 
 
 		 472 aa  174  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  30.89 
 
 		 473 aa  169  7e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  28.34 
 
 		 438 aa  159  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  28.22 
 
 		 481 aa  156  6e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  27.97 
 
 		 484 aa  150  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  29.06 
 
 		 504 aa  136  7.000000000000001e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.03 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  25.93 
 
 		 481 aa  132  9e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  26.17 
 
 		 592 aa  123  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  26.65 
 
 		 534 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  26.76 
 
 		 508 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  26.07 
 
 		 575 aa  119  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  28.78 
 
 		 533 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  28.29 
 
 		 533 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  26.74 
 
 		 576 aa  116  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  28.05 
 
 		 525 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  27.09 
 
 		 576 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  25.62 
 
 		 579 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  28.29 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  27.18 
 
 		 547 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  27.12 
 
 		 547 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  26.27 
 
 		 547 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  26.14 
 
 		 585 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  26.14 
 
 		 576 aa  106  9e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  25.21 
 
 		 576 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  26.42 
 
 		 579 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  25.36 
 
 		 576 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  23.72 
 
 		 456 aa  97.8  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  25.16 
 
 		 579 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  24.6 
 
 		 579 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.28 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03183  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02089  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.569859  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  34.38 
 
 		 578 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  24.94 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2470  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.55 
 
 		 380 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00847211  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002797  N-succinyl-L,L-diaminopimelate desuccinylase  23.26 
 
 		 378 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.74 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.473063  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  23.97 
 
 		 407 aa  73.9  0.000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  38.89 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.73 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  24.65 
 
 		 407 aa  73.2  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2443  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.46 
 
 		 377 aa  72.8  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.461656  normal  0.0916444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1992  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.74 
 
 		 380 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0274072  hitchhiker  0.000000073122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.43 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.2 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.06 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.438306  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.24 
 
 		 442 aa  72.4  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.89 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  28.87 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2367  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.87 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0319493  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2979  peptidase M20  27.88 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.923762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1814  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.72 
 
 		 376 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.93447  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1857  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.06 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2121  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.06 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1912  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.06 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000271061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2123  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.49 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0781  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.89 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.946099  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  25.2 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1484  hypothetical protein  23.82 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.555419  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1198  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.22 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1205  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.22 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.270871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.22 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1660  peptidase M20  26.94 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.22 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>