More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1291 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  100 
 
 		 467 aa  957    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  52.68 
 
 		 471 aa  481  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  45.82 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  47.79 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  43.13 
 
 		 470 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  44.52 
 
 		 473 aa  396  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  43.95 
 
 		 472 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  44.4 
 
 		 465 aa  389  1e-107  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  40.72 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  40.72 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  40.72 
 
 		 469 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  40.22 
 
 		 469 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  38.17 
 
 		 467 aa  332  1e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  37.87 
 
 		 468 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  38.48 
 
 		 468 aa  324  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  38.09 
 
 		 468 aa  323  6e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  37.26 
 
 		 468 aa  322  6e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  37.87 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  37.63 
 
 		 468 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  37.87 
 
 		 468 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  37.02 
 
 		 468 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  37.82 
 
 		 476 aa  299  8e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  36.74 
 
 		 464 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  35.37 
 
 		 465 aa  283  4.0000000000000003e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  38.54 
 
 		 470 aa  283  6.000000000000001e-75  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  36.24 
 
 		 467 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  34.92 
 
 		 465 aa  280  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  36.44 
 
 		 464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  35.7 
 
 		 444 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  34.19 
 
 		 464 aa  243  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  33.48 
 
 		 465 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.71 
 
 		 345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  34.37 
 
 		 449 aa  229  9e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  33.4 
 
 		 463 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  32.7 
 
 		 473 aa  220  3.9999999999999997e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  30.74 
 
 		 438 aa  214  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  32.82 
 
 		 450 aa  209  7e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  31.98 
 
 		 481 aa  207  3e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  30.84 
 
 		 481 aa  202  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  32.58 
 
 		 576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  32.03 
 
 		 576 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  31.76 
 
 		 484 aa  185  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.79 
 
 		 457 aa  172  9e-42  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  30.82 
 
 		 575 aa  172  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  29.48 
 
 		 534 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  28.54 
 
 		 504 aa  171  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  30.08 
 
 		 592 aa  170  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  29.65 
 
 		 579 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  27.22 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  27.88 
 
 		 576 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  28.07 
 
 		 585 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  27.86 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  27.98 
 
 		 508 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  28.27 
 
 		 576 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  29.58 
 
 		 525 aa  162  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  27.56 
 
 		 579 aa  156  7e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  27.31 
 
 		 579 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  29.51 
 
 		 533 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  28.17 
 
 		 578 aa  150  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  29.27 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  29.24 
 
 		 533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  28.92 
 
 		 547 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  29.64 
 
 		 547 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  28.67 
 
 		 547 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  25.85 
 
 		 591 aa  137  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  25.8 
 
 		 456 aa  133  5e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.07 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  34.75 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  24.74 
 
 		 396 aa  76.6  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1074  peptidase M20  32.72 
 
 		 474 aa  76.6  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0808796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.82 
 
 		 382 aa  76.3  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2352  acetylornithine deacetylase  32.2 
 
 		 424 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.737535  normal  0.411266 
 
 
-
 
NC_002950  PG0561  M20/M25/M40 family peptidase  32.53 
 
 		 451 aa  75.1  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  28.88 
 
 		 237 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  44.05 
 
 		 108 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  41.9 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  42.55 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  25.13 
 
 		 396 aa  74.7  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  24.06 
 
 		 415 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.5 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2187  peptidase M20  40.2 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.119199 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14090  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  32.69 
 
 		 469 aa  73.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  35.85 
 
 		 512 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.53 
 
 		 375 aa  72.8  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  49.33 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 		 395 aa  71.2  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0214  peptidase M20  32.21 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.58 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.48 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.14 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0240606  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.62 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  50.75 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3693  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2751  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2602  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.88 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>