More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1723 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  100 
 
 		 465 aa  947    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  64.58 
 
 		 464 aa  623  1e-177  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  39.57 
 
 		 464 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  38.88 
 
 		 465 aa  310  5e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  39.29 
 
 		 463 aa  306  4.0000000000000004e-82  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  38.44 
 
 		 465 aa  306  4.0000000000000004e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  40.44 
 
 		 464 aa  300  3e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  37.58 
 
 		 468 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  38.01 
 
 		 468 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  39.22 
 
 		 467 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  36.25 
 
 		 467 aa  276  7e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  37.61 
 
 		 468 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  38.1 
 
 		 468 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  37.01 
 
 		 468 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  37.66 
 
 		 468 aa  272  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  36.8 
 
 		 468 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  36.8 
 
 		 468 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  35.22 
 
 		 468 aa  268  2e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  36.2 
 
 		 465 aa  265  2e-69  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  37.2 
 
 		 470 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  34.99 
 
 		 469 aa  262  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  35.67 
 
 		 449 aa  249  8e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  34.33 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  34.33 
 
 		 469 aa  246  6.999999999999999e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  37.15 
 
 		 472 aa  246  8e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  35.15 
 
 		 450 aa  245  9.999999999999999e-64  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  35.75 
 
 		 444 aa  245  9.999999999999999e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  33.48 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  32.84 
 
 		 473 aa  240  4e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  33.19 
 
 		 471 aa  239  5.999999999999999e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  34.18 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  34.5 
 
 		 468 aa  235  1.0000000000000001e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  32.14 
 
 		 438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  32.08 
 
 		 473 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.69 
 
 		 457 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  31.43 
 
 		 481 aa  206  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  31.96 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.34 
 
 		 345 aa  190  4e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  29.58 
 
 		 476 aa  190  4e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  31.91 
 
 		 481 aa  187  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  28.03 
 
 		 484 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  26.78 
 
 		 579 aa  160  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  27.14 
 
 		 579 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  26.77 
 
 		 504 aa  149  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  26.5 
 
 		 579 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  27.74 
 
 		 576 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  27.42 
 
 		 579 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  26.45 
 
 		 592 aa  145  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  26.42 
 
 		 585 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  25.92 
 
 		 576 aa  144  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  24.27 
 
 		 576 aa  143  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  26.07 
 
 		 534 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  24.06 
 
 		 576 aa  142  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  25.94 
 
 		 576 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  26.98 
 
 		 525 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  24.21 
 
 		 575 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  25.2 
 
 		 508 aa  134  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  26.55 
 
 		 533 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  26.46 
 
 		 533 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  24.85 
 
 		 547 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  25.77 
 
 		 578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  25.75 
 
 		 533 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  24.65 
 
 		 547 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  24.7 
 
 		 547 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  26.14 
 
 		 456 aa  117  5e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1103  diaminopimelate aminotransferase  29.62 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1892  diaminopimelate aminotransferase  33.48 
 
 		 407 aa  91.3  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  25.9 
 
 		 396 aa  91.3  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  24.23 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1275  diaminopimelate aminotransferase  25.95 
 
 		 415 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000199982  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  25.53 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  25 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  25.87 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2967  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.53 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.546622 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  25.98 
 
 		 421 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  31.61 
 
 		 591 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  21.62 
 
 		 413 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.67 
 
 		 375 aa  77.4  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4599  Xaa-His dipeptidase, C-terminus  43.01 
 
 		 108 aa  77  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0836  diaminopimelate aminotransferase  26.56 
 
 		 423 aa  76.6  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.0000246987  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  22.03 
 
 		 411 aa  76.6  0.0000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  21.87 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1547  peptidase M20  25.65 
 
 		 455 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.955389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1441  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  33.55 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.17 
 
 		 375 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  23.03 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  32.8 
 
 		 415 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  27.98 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  26.07 
 
 		 237 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18404  predicted protein  41.57 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.346695  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2716  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.92 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0930351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2849  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.92 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2742  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.92 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  27.12 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2676  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  20.92 
 
 		 375 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  28.73 
 
 		 426 aa  70.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  38.82 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.65 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.65 
 
 		 407 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2618  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.15 
 
 		 375 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>