260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  100 
 
 		 484 aa  977    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  51.27 
 
 		 473 aa  469  1.0000000000000001e-131  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  46.3 
 
 		 481 aa  407  1.0000000000000001e-112  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  44.3 
 
 		 481 aa  372  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  31.59 
 
 		 465 aa  194  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  31.12 
 
 		 465 aa  194  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  31.76 
 
 		 467 aa  192  8e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  30.28 
 
 		 470 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  30.79 
 
 		 471 aa  188  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  30.21 
 
 		 467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  27.54 
 
 		 464 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  28.23 
 
 		 464 aa  181  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  30.75 
 
 		 463 aa  176  9e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  29.76 
 
 		 468 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  29.55 
 
 		 468 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  27.62 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  28.33 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  30.39 
 
 		 469 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  29.55 
 
 		 468 aa  170  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  26.81 
 
 		 438 aa  170  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  29.55 
 
 		 468 aa  169  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  29.09 
 
 		 468 aa  169  9e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  29.12 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  29.76 
 
 		 468 aa  169  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.01 
 
 		 457 aa  167  4e-40  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  29.34 
 
 		 468 aa  166  8e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  30.63 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  30.19 
 
 		 465 aa  164  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  28.94 
 
 		 472 aa  164  5.0000000000000005e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  28.09 
 
 		 464 aa  163  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  29.18 
 
 		 468 aa  160  7e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  27.27 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  27.97 
 
 		 449 aa  155  1e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  27.27 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  28.35 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  26.87 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  26.87 
 
 		 469 aa  150  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  29.26 
 
 		 576 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  28.37 
 
 		 576 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  28.73 
 
 		 444 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  29.91 
 
 		 575 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  27.57 
 
 		 579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  28.14 
 
 		 450 aa  133  6.999999999999999e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  26.08 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  27.73 
 
 		 476 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  27.81 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  28.54 
 
 		 579 aa  128  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  27.77 
 
 		 592 aa  128  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.22 
 
 		 345 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  27.77 
 
 		 576 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  27.08 
 
 		 579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  26.09 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  26.21 
 
 		 578 aa  107  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  26.43 
 
 		 585 aa  107  7e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  26.21 
 
 		 576 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  26.21 
 
 		 576 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  28.05 
 
 		 534 aa  104  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  27.15 
 
 		 525 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  23.59 
 
 		 504 aa  100  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  23.72 
 
 		 547 aa  90.1  9e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  23.94 
 
 		 547 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  23.48 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  22.66 
 
 		 533 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  22.13 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  22.6 
 
 		 533 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  29.69 
 
 		 591 aa  73.2  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0068  diaminopimelate aminotransferase  32.3 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0990  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.19 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.07 
 
 		 363 aa  63.2  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1152  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.35 
 
 		 366 aa  62  0.00000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135979  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.48 
 
 		 442 aa  60.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.34 
 
 		 410 aa  60.1  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2008  peptidase M20  30.26 
 
 		 451 aa  60.1  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.930842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  35.29 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1719  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase-like protein  29.02 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  34.48 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.14 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  28.5 
 
 		 396 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0627  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.52 
 
 		 365 aa  55.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.119075  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  29.27 
 
 		 510 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0240  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.23 
 
 		 367 aa  54.7  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2607  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.06 
 
 		 382 aa  54.3  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  40.28 
 
 		 388 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1420  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.56 
 
 		 383 aa  54.3  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000737808  normal  0.0270135 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6207  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.52 
 
 		 419 aa  53.5  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.134371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  32.92 
 
 		 387 aa  53.9  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5606  peptidase M20  28.83 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.750571  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6376  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.52 
 
 		 419 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0429  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.11 
 
 		 445 aa  53.5  0.000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6609  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.52 
 
 		 419 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0785768 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0180  diaminopimelate aminotransferase  31.53 
 
 		 415 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00038111  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  28.78 
 
 		 507 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  36.26 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0871  hypothetical protein  24.86 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0842  hypothetical protein  24.86 
 
 		 471 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0918  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.47 
 
 		 377 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  27.98 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  38.89 
 
 		 387 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  28.78 
 
 		 507 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  38.96 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>