More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34350 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34350  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  100 
 
 		 477 aa  927    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.174691  normal  0.112018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1474  peptidase M20  37.05 
 
 		 438 aa  213  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.739931  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1192  hypothetical protein  33.11 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0330579  normal  0.0773998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2015  peptidase M20  38.9 
 
 		 442 aa  202  9e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.251609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  34.62 
 
 		 434 aa  199  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21030  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  34.35 
 
 		 445 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.575645 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  34.47 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2253  hypothetical protein  34.6 
 
 		 441 aa  194  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.630202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2159  hypothetical protein  35 
 
 		 442 aa  190  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  33.26 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4882  hypothetical protein  35.97 
 
 		 443 aa  189  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.76417  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12171  hypothetical protein  34.63 
 
 		 450 aa  189  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.744068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19930  hypothetical protein  34.08 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.000000770232  decreased coverage  0.0000700572 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2768  hypothetical protein  34.55 
 
 		 449 aa  187  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000530587  hitchhiker  0.000231767 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2654  hypothetical protein  34.34 
 
 		 452 aa  187  5e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0469483  normal  0.0556402 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  187  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.235527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2313  hypothetical protein  34.86 
 
 		 442 aa  186  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4903  hypothetical protein  34.7 
 
 		 462 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308008  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2647  peptidase M20  35.15 
 
 		 442 aa  183  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4547  peptidase M20  34.55 
 
 		 440 aa  182  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  34.97 
 
 		 446 aa  182  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4949  peptidase M20  33.87 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.138857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03550  hypothetical protein  34.16 
 
 		 451 aa  178  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2128  peptidase M20  33.71 
 
 		 446 aa  177  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.797778  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3473  peptidase M20  33.87 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17060  hypothetical protein  33.26 
 
 		 439 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.760831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3037  hypothetical protein  33.71 
 
 		 451 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9227  peptidase M20  34.39 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2433  peptidase M20  32.28 
 
 		 448 aa  172  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00897679  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3164  hypothetical protein  33.56 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2654  peptidase M20  33.41 
 
 		 443 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3226  hypothetical protein  33.56 
 
 		 444 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.236057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3176  hypothetical protein  33.56 
 
 		 444 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2787  hypothetical protein  33.03 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1165  hypothetical protein  31.83 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0235842  normal  0.624672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3489  hypothetical protein  33.87 
 
 		 430 aa  169  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.919761 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3468  hypothetical protein  34.55 
 
 		 428 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  34.02 
 
 		 444 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  32.57 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7887  hypothetical protein  32.24 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0760347  normal  0.0510662 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13850  hypothetical protein  31.76 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000318209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  30.71 
 
 		 473 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3211  peptidase M20  32.06 
 
 		 468 aa  143  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6756  hypothetical protein  31.91 
 
 		 468 aa  140  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.557555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  29.93 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0248  hypothetical protein  27.72 
 
 		 469 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3665  hypothetical protein  26.77 
 
 		 478 aa  120  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.87 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_003296  RS00365  hypothetical protein  29.89 
 
 		 510 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.174414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2924  hypothetical protein  29.32 
 
 		 491 aa  107  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  27.54 
 
 		 472 aa  107  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1820  hypothetical protein  28.06 
 
 		 494 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1781  hypothetical protein  25.06 
 
 		 485 aa  105  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4704  hypothetical protein  29.23 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0146867 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3627  hypothetical protein  29.23 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0110  hypothetical protein  26.34 
 
 		 549 aa  101  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12324  normal  0.549417 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0695  hypothetical protein  27.95 
 
 		 493 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6284  peptidase M20  30.25 
 
 		 489 aa  97.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  24.82 
 
 		 391 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4262  hypothetical protein  28.5 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0216  hypothetical protein  27.95 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.675958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0107  hypothetical protein  28.87 
 
 		 493 aa  93.2  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0982  hypothetical protein  24.51 
 
 		 508 aa  93.2  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.94 
 
 		 388 aa  91.3  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1231  peptidase M20  22.68 
 
 		 485 aa  90.5  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0416  hypothetical protein  28.36 
 
 		 493 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1037  peptidase M20  28.36 
 
 		 497 aa  89  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.34 
 
 		 388 aa  86.7  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1065  hypothetical protein  25.06 
 
 		 490 aa  86.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.961267 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.12 
 
 		 385 aa  83.2  0.000000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.306111  normal  0.0744523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0989  hypothetical protein  24.21 
 
 		 476 aa  83.2  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.306467 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1670  hypothetical protein  27.3 
 
 		 467 aa  81.6  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0904676  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10500  hypothetical protein  24.88 
 
 		 483 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.91 
 
 		 393 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  31.31 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0141  hypothetical protein  27.59 
 
 		 468 aa  79.3  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0813471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.51 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0748  hypothetical protein  27.51 
 
 		 465 aa  77.8  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000168707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.56 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0094  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.98 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.04 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1266  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.59 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  27.72 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3615  hypothetical protein  25.41 
 
 		 494 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  24.2 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  22.49 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0041  hypothetical protein  26.94 
 
 		 493 aa  71.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  25.28 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.12 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  21.77 
 
 		 402 aa  70.9  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4389  hypothetical protein  28.07 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  28.06 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0144  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.66 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.131428  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.37 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.1 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.41 
 
 		 381 aa  69.7  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2475  acetylornithine deacetylase  27.25 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0713768  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8178  peptidase M20  30.26 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.74 
 
 		 375 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>