More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3696 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  100 
 
 		 452 aa  907    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  67.3 
 
 		 461 aa  561  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  67.3 
 
 		 454 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  46.53 
 
 		 402 aa  357  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  39.86 
 
 		 440 aa  270  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  41.8 
 
 		 453 aa  270  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  39.41 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  38.04 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  36.11 
 
 		 361 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  31.09 
 
 		 344 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  34.51 
 
 		 337 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  27.84 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  26.42 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.62 
 
 		 354 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  25.99 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  23.96 
 
 		 370 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  26.42 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  25.13 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  30.93 
 
 		 377 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  25.79 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  25.77 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  30.84 
 
 		 416 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  25.64 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  28 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  28.61 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.45 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  25.33 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  26.11 
 
 		 409 aa  67  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  26.7 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  27.21 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6288  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  33.33 
 
 		 361 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.68 
 
 		 402 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  24.73 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  27.21 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.59 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.92 
 
 		 354 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  22.73 
 
 		 383 aa  64.7  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  27.02 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.47 
 
 		 396 aa  64.3  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  25.65 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  25.83 
 
 		 372 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  28.35 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.5 
 
 		 375 aa  63.2  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  28.86 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  24.37 
 
 		 413 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  23.98 
 
 		 394 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  27.7 
 
 		 408 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  26.77 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  24.93 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  26 
 
 		 369 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  25 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.78 
 
 		 371 aa  61.2  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.390833 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3310  acetyl-lysine deacetylase  25.85 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3459  acetyl-lysine deacetylase  31.25 
 
 		 352 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059344 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1614  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.7 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  26.25 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  24.93 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  27.19 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.33 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  28.8 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  28.8 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  26.79 
 
 		 375 aa  60.5  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.58 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.96 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  31.03 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  25.28 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  25.65 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.08 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.15 
 
 		 394 aa  59.3  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  28.27 
 
 		 383 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2180  acetyl-lysine deacetylase  26.48 
 
 		 348 aa  58.9  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.749889 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  25.38 
 
 		 388 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11226  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.86 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  25.6 
 
 		 438 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2723  acetyl-lysine deacetylase  29.55 
 
 		 366 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0548  acetylornithine deacetylase  25.82 
 
 		 424 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000707223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  26.9 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.71 
 
 		 378 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  24.06 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  25.25 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.34 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0949  peptidase M20  31.18 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0792723  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  25.58 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0497  acetylornithine deacetylase  26.42 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00375868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  24.31 
 
 		 422 aa  57.4  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  26.01 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 		 359 aa  57  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  25.32 
 
 		 424 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  27.34 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  22.96 
 
 		 375 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  23.03 
 
 		 401 aa  57  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  25.63 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  22.67 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  25.35 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 371 aa  56.6  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  25.67 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>