More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0989 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0989  peptidase M20  100 
 
 		 371 aa  764    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  45.56 
 
 		 379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  44.78 
 
 		 403 aa  279  6e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3178  peptidase M20  44.93 
 
 		 403 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0110526  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0275  acetylornithine deacetylase  42.09 
 
 		 401 aa  255  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000141091  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  27.09 
 
 		 341 aa  112  9e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.88 
 
 		 388 aa  106  6e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  28.65 
 
 		 368 aa  104  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  27.79 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  27.25 
 
 		 364 aa  103  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.37 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.32 
 
 		 396 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 		 381 aa  98.2  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  27.03 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  28.23 
 
 		 382 aa  96.3  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  26.14 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  28.7 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  25.29 
 
 		 378 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  26.05 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  27.35 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  27.4 
 
 		 387 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  26.01 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0076  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.82 
 
 		 404 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  33.06 
 
 		 357 aa  89.4  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2064  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.928564  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  26.63 
 
 		 389 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2101  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 		 407 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.239154  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  26.77 
 
 		 392 aa  88.2  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  22.66 
 
 		 381 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  25.36 
 
 		 428 aa  88.2  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  27.75 
 
 		 384 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.36 
 
 		 414 aa  87  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  25.47 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6421  acetylornithine deacetylase  25.52 
 
 		 390 aa  86.7  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.501182  normal  0.657059 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  26.76 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  26.63 
 
 		 386 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2796  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.12 
 
 		 397 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.884075 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  25.57 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0377  peptidase M20  27.47 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  25.75 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2432  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.03 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402388  normal  0.522542 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  27 
 
 		 388 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  22.19 
 
 		 417 aa  85.1  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0227  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 382 aa  84.7  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1139  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.86 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0335688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  27.02 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  26.92 
 
 		 395 aa  83.6  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  25.36 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  24.23 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  25.26 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.65 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  25.48 
 
 		 386 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  24.43 
 
 		 337 aa  82.4  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  27.09 
 
 		 397 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  23.04 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  25.48 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  26.86 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  26.3 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.08 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  25.76 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  23.56 
 
 		 404 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  24.53 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  26.27 
 
 		 386 aa  80.1  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  26.82 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  23.23 
 
 		 378 aa  80.1  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.9 
 
 		 400 aa  79.7  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  23.88 
 
 		 386 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  26.24 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.08 
 
 		 398 aa  79.7  0.00000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.5 
 
 		 338 aa  79.3  0.00000000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  27.01 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 		 383 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 		 403 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.77 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  25.42 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  25.21 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  25.49 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.09 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  23.96 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  26.01 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  24.09 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 383 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  26.01 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4443  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 383 aa  77.8  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  26.01 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  24.73 
 
 		 416 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  30.86 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.51 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  25.91 
 
 		 586 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.53 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>