More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0377 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0377  peptidase M20  100 
 
 
367 aa  756    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  28.85 
 
 
341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1671  acetylornithine deacetylase  33.85 
 
 
367 aa  113  6e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.09506  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.82 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.13 
 
 
426 aa  94  3e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  25.7 
 
 
422 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 
422 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 
422 aa  87  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 
422 aa  87  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.28 
 
 
399 aa  85.9  9e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  25.93 
 
 
422 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  30.58 
 
 
369 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  28.31 
 
 
374 aa  85.9  0.000000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0989  peptidase M20  27.47 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3894  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.2 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  25.62 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.3 
 
 
422 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.85 
 
 
398 aa  85.1  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  25 
 
 
422 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.92 
 
 
395 aa  84  0.000000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.58 
 
 
424 aa  83.6  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  25.31 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  27.27 
 
 
420 aa  82.8  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  25.31 
 
 
422 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.07 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.48 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 
404 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.31 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3020  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.03 
 
 
431 aa  80.5  0.00000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.425319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.68 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  30.7 
 
 
413 aa  77.4  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  24.62 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.04 
 
 
399 aa  77  0.0000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  25.93 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0783  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.81 
 
 
435 aa  75.5  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.54 
 
 
387 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1579  acetylornithine deacetylase  26.68 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.669783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  25.4 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  24.2 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3363  acetylornithine deacetylase  33.01 
 
 
375 aa  73.6  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.288283  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  24.14 
 
 
406 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1880  acetylornithine deacetylase  25.95 
 
 
387 aa  73.6  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1499  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.43 
 
 
441 aa  72.8  0.000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0237  acetylornithine deacetylase  25.51 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0369  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.52 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.4 
 
 
424 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0401  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.38 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309762  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  25.41 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  22.84 
 
 
382 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  24.77 
 
 
446 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4425  acetylornithine deacetylase  26.96 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.779793  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.66 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.27 
 
 
433 aa  71.2  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 
406 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  26.27 
 
 
387 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  29.28 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  25.9 
 
 
399 aa  70.1  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.83 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3336  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.73 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0627884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 
406 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  34.52 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 
380 aa  69.7  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2580  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.02 
 
 
357 aa  69.7  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  34.52 
 
 
432 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.17 
 
 
431 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  23.51 
 
 
406 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  26.13 
 
 
374 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  23.51 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4203  peptidase M20  26.48 
 
 
360 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0267175  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0717  acetylornithine deacetylase  25.53 
 
 
388 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.150361  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  25.56 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  26.47 
 
 
384 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2048  acetylornithine deacetylase  23.81 
 
 
418 aa  67  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
400 aa  67  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1014  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.39 
 
 
393 aa  66.6  0.0000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00488739 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  25.34 
 
 
379 aa  66.2  0.0000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  26.42 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  29.95 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  27.62 
 
 
376 aa  66.2  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0439  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.15 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1143  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.78 
 
 
378 aa  65.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.575079  decreased coverage  0.00167008 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  25 
 
 
428 aa  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.41 
 
 
349 aa  65.5  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2126  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.08 
 
 
376 aa  65.1  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.521922  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.92 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  25.69 
 
 
416 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  25.63 
 
 
374 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1085  peptidase M20  24.5 
 
 
403 aa  64.7  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000939958 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  26.47 
 
 
384 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  26.19 
 
 
424 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  31.14 
 
 
432 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.87 
 
 
402 aa  64.3  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5029  acetylornithine deacetylase  28.99 
 
 
373 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2313  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.3 
 
 
389 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0897692 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  21.52 
 
 
384 aa  64.3  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  26.22 
 
 
463 aa  63.9  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  23.85 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>