More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1671 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1671  acetylornithine deacetylase  100 
 
 		 367 aa  721    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.09506  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0377  peptidase M20  33.95 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  29.22 
 
 		 341 aa  116  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.32 
 
 		 396 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.48 
 
 		 413 aa  95.9  9e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.58 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.97 
 
 		 378 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  30.33 
 
 		 387 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.24 
 
 		 389 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3753  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29 
 
 		 387 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.518187  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  24.92 
 
 		 428 aa  89.7  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4005  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.44 
 
 		 400 aa  89.7  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.360154  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  28.25 
 
 		 383 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0420  putative acetylornithine deacetylase  21.74 
 
 		 382 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2538  peptidase M20  29.68 
 
 		 369 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.561977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0637  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.41 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00222046  hitchhiker  0.0000509449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0201  acetylornithine deacetylase  27.13 
 
 		 386 aa  87.8  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000604653  normal  0.090573 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1823  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.56 
 
 		 369 aa  87.4  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.248504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  28.79 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4277  acetylornithine deacetylase  27.51 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00886468  normal  0.333205 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  28.45 
 
 		 388 aa  85.1  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  28.04 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  30.89 
 
 		 383 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  26.45 
 
 		 395 aa  83.2  0.000000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  31.88 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  30.72 
 
 		 384 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2607  acetylornithine deacetylase ArgE  27.04 
 
 		 379 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000028311  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1674  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.06 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000241888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0328  acetylornithine deacetylase  28.48 
 
 		 383 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4015  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  27.24 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  29.68 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  27.68 
 
 		 389 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  27.76 
 
 		 365 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1040  peptidase dimerisation  27.38 
 
 		 337 aa  80.9  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.108705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  28.66 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  25.62 
 
 		 381 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.3 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  24.83 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  27.53 
 
 		 387 aa  80.9  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  28.41 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  28.8 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0445  acetylornithine deacetylase  24.69 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  28.42 
 
 		 424 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1477  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  31.88 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  27.62 
 
 		 378 aa  79  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0573  acetylornithine deacetylase  28.53 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.280832  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  26.06 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  27.07 
 
 		 386 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.37 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5867  peptidase M20  25.06 
 
 		 434 aa  77  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0353  acetylornithine deacetylase  27.27 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  24.04 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  26.61 
 
 		 390 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  27.97 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  27.91 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  26.59 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.33 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  29.78 
 
 		 376 aa  76.3  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.44 
 
 		 335 aa  76.3  0.0000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0594  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.28 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  23.74 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  28.04 
 
 		 386 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  26.03 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6134  acetylornithine deacetylase  24.55 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4782  acetylornithine deacetylase  26.2 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142352 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  24.55 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  24.55 
 
 		 406 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.53 
 
 		 335 aa  75.9  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  28.04 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  25.76 
 
 		 382 aa  74.7  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1969  acetylornithine deacetylase  24.25 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.850845  normal  0.0303442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  27.57 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  25.66 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.84 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  24.55 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.01 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  26.11 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 378 aa  74.3  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  28.2 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11210  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  29.94 
 
 		 360 aa  74.7  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0095  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.93 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.06 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  27.68 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  27.06 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  24.16 
 
 		 426 aa  73.9  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  27.06 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 		 384 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2929  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.03 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000511731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5256  acetylornithine deacetylase  23.95 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000221107  normal  0.704477 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  24.16 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>