128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0612 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0612  peptidase M20  100 
 
 		 550 aa  1147    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  34.65 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28027  predicted protein  32.26 
 
 		 401 aa  67  0.0000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.19 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  39.6 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2118  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  34.9 
 
 		 422 aa  63.2  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3755  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.99 
 
 		 431 aa  63.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0601129  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3625  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  25.62 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.209482  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2321  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  32.5 
 
 		 424 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.665958  normal  0.0430362 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05749  putative acetylornithine deacetylase (Eurofung)  28.45 
 
 		 424 aa  62  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0187608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  38.61 
 
 		 424 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2692  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  39.32 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.310505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  36.79 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1036  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.58 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.98683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2875  acetylornithine deacetylase  36.36 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3347  acetylornithine deacetylase  31.25 
 
 		 436 aa  60.1  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  34.31 
 
 		 422 aa  59.3  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0377  peptidase M20  34.33 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3737  acetylornithine deacetylase  36.36 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.565642  normal  0.160134 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1080  acetylornithine deacetylase  33.82 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 		 422 aa  56.6  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2142  acetylornithine deacetylase  27.04 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0818142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2080  acetylornithine deacetylase  27.04 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  29.3 
 
 		 416 aa  55.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2297  acetylornithine deacetylase  27.04 
 
 		 422 aa  55.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  27.04 
 
 		 422 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  33.33 
 
 		 349 aa  54.7  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2405  acetylornithine deacetylase  27.04 
 
 		 422 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.741155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  30 
 
 		 422 aa  53.5  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 		 382 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3492  acetylornithine deacetylase  29 
 
 		 432 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.152448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2322  acetylornithine deacetylase  26.42 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1610  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.4 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  26.25 
 
 		 422 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  26.25 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  32.61 
 
 		 391 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  38.46 
 
 		 389 aa  52  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1685  acetylornithine deacetylase  27.67 
 
 		 422 aa  52  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.56308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  30.95 
 
 		 392 aa  51.2  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  33.67 
 
 		 429 aa  51.2  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.6 
 
 		 429 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0170  acetyl-lysine deacetylase  29.56 
 
 		 345 aa  51.2  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000443828  normal  0.22907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4337  peptidase M20  32.82 
 
 		 379 aa  51.2  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  35.35 
 
 		 409 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2569  acetylornithine deacetylase  25.96 
 
 		 432 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.999576  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  28.95 
 
 		 394 aa  50.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  34.04 
 
 		 335 aa  50.8  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  33.33 
 
 		 335 aa  50.8  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  29.81 
 
 		 419 aa  50.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  33.91 
 
 		 390 aa  50.8  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  35.11 
 
 		 360 aa  50.4  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  35.35 
 
 		 412 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2664  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.71 
 
 		 427 aa  50.4  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.18198 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  36 
 
 		 428 aa  50.4  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  33.33 
 
 		 436 aa  50.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  28.75 
 
 		 416 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  34.71 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4522  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.5 
 
 		 428 aa  49.7  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  33.98 
 
 		 433 aa  50.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.89 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  35.17 
 
 		 389 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0411  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  30.87 
 
 		 437 aa  49.3  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  32.23 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.73 
 
 		 368 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0097  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.83 
 
 		 437 aa  48.5  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395035  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1147  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 		 386 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.299531  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  32.69 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0019  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.5 
 
 		 428 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.191094  hitchhiker  0.000354462 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  31.73 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  34.96 
 
 		 388 aa  48.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  32.17 
 
 		 413 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  30.77 
 
 		 438 aa  47.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1025  peptidase M20  28.33 
 
 		 362 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  33.98 
 
 		 394 aa  47.4  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.28 
 
 		 433 aa  47.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  34.43 
 
 		 402 aa  47.4  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  31.72 
 
 		 335 aa  47.4  0.0007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3889  acetylornithine deacetylase  25 
 
 		 426 aa  47.4  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.465317 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  32.17 
 
 		 381 aa  47.4  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.5 
 
 		 384 aa  47  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4285  acetylornithine deacetylase  28.36 
 
 		 432 aa  47  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  32.17 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  30.33 
 
 		 384 aa  46.6  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3374  acetylornithine deacetylase or succinyl- diaminopimelate desuccinylase  32.5 
 
 		 424 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.7 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3135  acetylornithine deacetylase  25.24 
 
 		 432 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.35 
 
 		 338 aa  47  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  34.69 
 
 		 368 aa  47  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  32.65 
 
 		 410 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  30.61 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.59 
 
 		 375 aa  45.8  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  39.08 
 
 		 383 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0459  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 		 382 aa  45.4  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2049  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 		 416 aa  45.4  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.686913 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1406  acetylornithine deacetylase  32.66 
 
 		 427 aa  45.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.566514  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  27.33 
 
 		 401 aa  45.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  31.25 
 
 		 383 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  25.81 
 
 		 409 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0744  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.88 
 
 		 453 aa  45.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>