More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2204 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  100 
 
 		 410 aa  832    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  73.09 
 
 		 432 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  72.03 
 
 		 415 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  69.41 
 
 		 412 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  70.56 
 
 		 409 aa  553  1e-156  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  41.33 
 
 		 436 aa  316  4e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  46.47 
 
 		 394 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  41.96 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  41.96 
 
 		 436 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  42.43 
 
 		 438 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  43.44 
 
 		 424 aa  299  6e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  41.21 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  40.48 
 
 		 428 aa  296  5e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  42.42 
 
 		 417 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  40.25 
 
 		 409 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  40.15 
 
 		 413 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  40.63 
 
 		 413 aa  279  6e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  40.82 
 
 		 416 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  40.25 
 
 		 429 aa  274  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  39.63 
 
 		 422 aa  270  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  35.11 
 
 		 383 aa  188  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  30.91 
 
 		 408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  35.26 
 
 		 378 aa  182  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  33.95 
 
 		 409 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  30.91 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  30.65 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  31.54 
 
 		 388 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  29.79 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  31.22 
 
 		 372 aa  166  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  30.87 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  36.15 
 
 		 367 aa  160  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  29.58 
 
 		 372 aa  160  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  34.57 
 
 		 420 aa  159  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  28.64 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  30.26 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  28.5 
 
 		 407 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  28.91 
 
 		 376 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  33.15 
 
 		 383 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  33.33 
 
 		 383 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.04 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.46 
 
 		 376 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.57 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.57 
 
 		 358 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  28.34 
 
 		 372 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  35.13 
 
 		 375 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  31.44 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  29.33 
 
 		 376 aa  142  9e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  31.54 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  29.37 
 
 		 376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  29.13 
 
 		 376 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  30.37 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  30.37 
 
 		 388 aa  139  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  36.22 
 
 		 391 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  28.54 
 
 		 423 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  29.92 
 
 		 388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  32.87 
 
 		 389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  27.66 
 
 		 376 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  29.46 
 
 		 382 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  28.27 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  29.46 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  28.73 
 
 		 391 aa  130  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  30.2 
 
 		 382 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.49 
 
 		 363 aa  129  7.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  32.14 
 
 		 377 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  29.49 
 
 		 385 aa  127  4.0000000000000003e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.94 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  29.23 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  29.44 
 
 		 376 aa  123  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  34.89 
 
 		 412 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  32.53 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  27.72 
 
 		 418 aa  113  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  31.66 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  27.97 
 
 		 387 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  29.15 
 
 		 402 aa  106  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  29.38 
 
 		 401 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  26.54 
 
 		 424 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  25.18 
 
 		 434 aa  100  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  28.78 
 
 		 402 aa  97.8  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  27.36 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  28.27 
 
 		 368 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  31.4 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  27.24 
 
 		 364 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  31.85 
 
 		 377 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  27.25 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  26.36 
 
 		 365 aa  80.1  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5950  acetylornithine deacetylase  26.29 
 
 		 383 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.479541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  26.82 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  29.72 
 
 		 372 aa  79.7  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  26.46 
 
 		 382 aa  77  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  29.76 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  27.52 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  25.94 
 
 		 383 aa  75.9  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  30.47 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  26.52 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68770  acetylornithine deacetylase  26.03 
 
 		 384 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  28.62 
 
 		 375 aa  75.1  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  28.24 
 
 		 383 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  25.19 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  26.2 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  26.2 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>