More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3233 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  100 
 
 		 413 aa  832    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  95.4 
 
 		 413 aa  765    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  86.17 
 
 		 409 aa  696    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  70.62 
 
 		 394 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  40.92 
 
 		 432 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  40.68 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  41.69 
 
 		 412 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  41.69 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  40.15 
 
 		 410 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  39.33 
 
 		 418 aa  279  7e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  39.39 
 
 		 436 aa  265  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  38.64 
 
 		 436 aa  263  6e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  39.14 
 
 		 436 aa  261  1e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  38.83 
 
 		 428 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  39.37 
 
 		 417 aa  256  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  38.66 
 
 		 438 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  39.46 
 
 		 424 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  36.96 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  38.07 
 
 		 422 aa  234  3e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  35.43 
 
 		 429 aa  231  3e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  36.14 
 
 		 385 aa  223  6e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  36.49 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  37.03 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  35.9 
 
 		 383 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  37.16 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  33.51 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  33.52 
 
 		 409 aa  186  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  34.66 
 
 		 378 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  31.5 
 
 		 374 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  33.87 
 
 		 408 aa  179  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  32.02 
 
 		 374 aa  179  8e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.68 
 
 		 376 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  34.65 
 
 		 372 aa  176  9e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  34.97 
 
 		 372 aa  173  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  34.32 
 
 		 372 aa  172  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  28.89 
 
 		 407 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.99 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.99 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  29.4 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  32.97 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  32.97 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  35.19 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  36.51 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  31.54 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  33.78 
 
 		 389 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.91 
 
 		 376 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  30.98 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  33.69 
 
 		 420 aa  158  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  30.35 
 
 		 382 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  30.67 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  30.35 
 
 		 382 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  30.54 
 
 		 376 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  30.43 
 
 		 376 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  32.28 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  32.79 
 
 		 367 aa  152  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  33.51 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  29.57 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  30.47 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  29.54 
 
 		 382 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  32.44 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  31.36 
 
 		 388 aa  145  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.16 
 
 		 405 aa  143  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  29.46 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  29.19 
 
 		 376 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  28.73 
 
 		 376 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  30.32 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  31.75 
 
 		 385 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  31.97 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  31.05 
 
 		 405 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  28.91 
 
 		 424 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  29.08 
 
 		 376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  30.56 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  33.55 
 
 		 401 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  28.34 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  32.37 
 
 		 381 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  27.74 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  28.16 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  27.98 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  31.54 
 
 		 384 aa  110  5e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  29.04 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  28 
 
 		 436 aa  99  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  27.64 
 
 		 441 aa  93.6  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  27.2 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1635  peptidase M20  30.89 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  30.34 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  28.49 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  27.12 
 
 		 368 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  27.78 
 
 		 381 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  25.13 
 
 		 374 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  27.43 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  25.95 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  26.29 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  27.09 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  26.18 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  28.69 
 
 		 377 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  26.65 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  26.77 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  26.84 
 
 		 387 aa  77.4  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  27.56 
 
 		 374 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  27.03 
 
 		 372 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>