285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3983 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  100 
 
 		 381 aa  734    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  51.44 
 
 		 385 aa  326  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  48.16 
 
 		 388 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  45.9 
 
 		 378 aa  278  9e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  42.97 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  39.63 
 
 		 376 aa  252  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  42.13 
 
 		 372 aa  249  6e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  47.56 
 
 		 367 aa  243  5e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  38.86 
 
 		 391 aa  224  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  39.45 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  39.45 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  44.65 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  47.95 
 
 		 420 aa  220  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  45.26 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  44.35 
 
 		 376 aa  212  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  40.27 
 
 		 375 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  39.67 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  41.02 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  39.74 
 
 		 376 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  40.81 
 
 		 377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  35.79 
 
 		 376 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  37.94 
 
 		 376 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  37.57 
 
 		 376 aa  188  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  33.6 
 
 		 385 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  39.13 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  35.69 
 
 		 376 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  37.13 
 
 		 376 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  36.68 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  32.36 
 
 		 374 aa  176  9e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  31.83 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  37.27 
 
 		 376 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  35.23 
 
 		 408 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  34.59 
 
 		 383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.88 
 
 		 394 aa  160  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  36.46 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  37.67 
 
 		 409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  31.7 
 
 		 432 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  34.96 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  35.16 
 
 		 407 aa  155  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  31.44 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  34.71 
 
 		 407 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  38.74 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  39.93 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  35.14 
 
 		 363 aa  145  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  33.42 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  34.65 
 
 		 382 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  31.96 
 
 		 412 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  38.41 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  35.12 
 
 		 389 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  29.5 
 
 		 429 aa  142  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  31.7 
 
 		 409 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  34.74 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.13 
 
 		 405 aa  139  6e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  30.2 
 
 		 436 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  29.38 
 
 		 436 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  30.15 
 
 		 415 aa  137  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  32.69 
 
 		 413 aa  136  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  32.37 
 
 		 413 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  29.74 
 
 		 436 aa  136  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  30.55 
 
 		 409 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  31.06 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  30.08 
 
 		 438 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.01 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.01 
 
 		 358 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  34.57 
 
 		 385 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  31.17 
 
 		 372 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  30.97 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  31.49 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  34.18 
 
 		 402 aa  117  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  29.26 
 
 		 417 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  27.49 
 
 		 416 aa  112  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  30.13 
 
 		 424 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  32.65 
 
 		 402 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  29.87 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  29.03 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  31.19 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  29.61 
 
 		 434 aa  96.3  9e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  28.48 
 
 		 432 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  25.25 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  32.41 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  22.16 
 
 		 383 aa  71.2  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  25.27 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  27.81 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  23.22 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  28.13 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  26.03 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  28 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  26.13 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  22.96 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3291  acetylornithine deacetylase  27.96 
 
 		 383 aa  65.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  30.13 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  25.47 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  29.09 
 
 		 403 aa  63.2  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  29.57 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  26.96 
 
 		 379 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  31.43 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2793  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.77 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.368215 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1265  hypothetical protein  27.88 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.729138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  28.21 
 
 		 391 aa  60.1  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.59 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>