More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1939 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  803    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  68.85 
 
 
401 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  65.58 
 
 
402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  47.01 
 
 
423 aa  348  9e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  44.79 
 
 
407 aa  320  3.9999999999999996e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  43.42 
 
 
407 aa  319  6e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  46.13 
 
 
418 aa  316  5e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  39.47 
 
 
387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  31.03 
 
 
374 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  30.65 
 
 
409 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  30.24 
 
 
374 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  30.47 
 
 
413 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  30.73 
 
 
413 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  32.38 
 
 
394 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  33.16 
 
 
372 aa  153  5e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  31.38 
 
 
385 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  34.45 
 
 
391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  34.95 
 
 
378 aa  147  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  33.16 
 
 
377 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  32.74 
 
 
385 aa  142  8e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  35.08 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  35.08 
 
 
388 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  36.25 
 
 
412 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  32.24 
 
 
389 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  35.95 
 
 
391 aa  139  8.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  30.17 
 
 
415 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  33.5 
 
 
376 aa  137  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  34.38 
 
 
375 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  35.11 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  31.61 
 
 
372 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  35.91 
 
 
376 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  32.9 
 
 
383 aa  132  9e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  31.71 
 
 
412 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  31.34 
 
 
409 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  29.71 
 
 
376 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  32.6 
 
 
388 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  36.21 
 
 
420 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  29.87 
 
 
432 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  33.78 
 
 
376 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  30.17 
 
 
416 aa  122  8e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  29.15 
 
 
410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.57 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.57 
 
 
358 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  31.55 
 
 
405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  32.78 
 
 
363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  30.75 
 
 
376 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  31.11 
 
 
376 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  29.22 
 
 
408 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  32.64 
 
 
382 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  32 
 
 
388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  34.46 
 
 
382 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  35.62 
 
 
367 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  32.29 
 
 
383 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  31.06 
 
 
376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  34.2 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  31.36 
 
 
409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  30.57 
 
 
376 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  27.92 
 
 
438 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  32.8 
 
 
376 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  30.96 
 
 
383 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  28.96 
 
 
424 aa  109  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  32.81 
 
 
376 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  33.01 
 
 
385 aa  107  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  29.87 
 
 
417 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  33.59 
 
 
382 aa  106  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  29.25 
 
 
436 aa  106  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  27.93 
 
 
424 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.33 
 
 
394 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  32.55 
 
 
381 aa  105  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  25.7 
 
 
429 aa  102  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  28 
 
 
436 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.63 
 
 
405 aa  101  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  27.75 
 
 
436 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  27.79 
 
 
428 aa  101  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  30.52 
 
 
422 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  27.25 
 
 
434 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  28.09 
 
 
376 aa  97.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  28.88 
 
 
418 aa  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  27.12 
 
 
436 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  28.38 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  25.57 
 
 
368 aa  84.3  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  27.63 
 
 
368 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  24.28 
 
 
368 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  24.68 
 
 
381 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  31.71 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  27.19 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  27.8 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  23.81 
 
 
368 aa  79  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  32.34 
 
 
441 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39150  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.75 
 
 
396 aa  76.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.96869  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  24.06 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1496  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.66 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1819  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.66 
 
 
382 aa  75.1  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  30.03 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1130  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.33 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  20.38 
 
 
743 aa  72.8  0.000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.33 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.882269  normal  0.131095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  27.7 
 
 
372 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4199  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.33 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0319412  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  36.05 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>