182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1297 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  100 
 
 		 434 aa  890    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  40.97 
 
 		 424 aa  312  7.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  41.61 
 
 		 441 aa  310  4e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  38.71 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  38.07 
 
 		 436 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  29.02 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  30.59 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  29.64 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  27.3 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  29.72 
 
 		 413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  25.36 
 
 		 388 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  29.04 
 
 		 413 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.09 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  29.59 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  29.59 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  28.03 
 
 		 389 aa  103  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  25.06 
 
 		 432 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  29.02 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  29.14 
 
 		 382 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  29.06 
 
 		 394 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  25.18 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  25.06 
 
 		 412 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  24.76 
 
 		 415 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  26.54 
 
 		 416 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  27.3 
 
 		 376 aa  98.2  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  27.39 
 
 		 385 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  25 
 
 		 423 aa  95.1  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.19 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.19 
 
 		 358 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  25.7 
 
 		 409 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  27 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  26.76 
 
 		 372 aa  90.5  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  26.44 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  27.14 
 
 		 401 aa  88.6  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.07 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  28.01 
 
 		 385 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  26.18 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  24.13 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  28.95 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  28.22 
 
 		 372 aa  85.1  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  26.45 
 
 		 391 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  23.75 
 
 		 407 aa  84.3  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  24.27 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  24.27 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  23.8 
 
 		 374 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  29.27 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  23.54 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  27.01 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  27.76 
 
 		 378 aa  81.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  28.96 
 
 		 375 aa  81.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  25.32 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.29 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  27.76 
 
 		 420 aa  80.1  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  24.24 
 
 		 418 aa  80.1  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.38 
 
 		 394 aa  80.5  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  26.73 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  25.2 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  25.95 
 
 		 376 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  24.87 
 
 		 422 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  32.52 
 
 		 418 aa  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  24.15 
 
 		 438 aa  76.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  27.44 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  25.93 
 
 		 429 aa  75.1  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  26.34 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  25 
 
 		 402 aa  73.2  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  27.39 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  25.38 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  25.68 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  27.16 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  27.55 
 
 		 412 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  23.67 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  24.87 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  23.22 
 
 		 436 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  26.23 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  23.71 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  26.25 
 
 		 376 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  26.02 
 
 		 405 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  28.9 
 
 		 388 aa  64.3  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.57 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  25.06 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  26.36 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  23.39 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  26.69 
 
 		 743 aa  60.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  33.09 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3309  hypothetical protein  27.72 
 
 		 472 aa  57  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0974288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  24.21 
 
 		 417 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  29.33 
 
 		 413 aa  54.3  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  29.21 
 
 		 378 aa  53.5  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3604  peptidase M20  25.62 
 
 		 434 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.682601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1484  peptidase M20  25.58 
 
 		 391 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1905  hypothetical protein  27.05 
 
 		 434 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000097088 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  27.52 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3442  acetylornithine deacetylase  23.58 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12180  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.64 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0246803  normal  0.255441 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2162  hypothetical protein  30.2 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.335606  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.7 
 
 		 393 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  23.91 
 
 		 385 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2506  acetylornithine deacetylase  22.85 
 
 		 426 aa  50.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183541  normal  0.946176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2619  hypothetical protein  25.68 
 
 		 444 aa  50.4  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.913218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3160  peptidase M20  26.92 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119571  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>