118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0524 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  100 
 
 		 432 aa  883    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  38.6 
 
 		 441 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  40.69 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  38.71 
 
 		 434 aa  268  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  36.49 
 
 		 436 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  31.22 
 
 		 382 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  30.88 
 
 		 382 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  30.64 
 
 		 382 aa  134  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  30.64 
 
 		 382 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  28.75 
 
 		 388 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  30.08 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  28.21 
 
 		 413 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  29.08 
 
 		 389 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  27.85 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  30.71 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  28.16 
 
 		 413 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  27.25 
 
 		 376 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  25.92 
 
 		 374 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  28.17 
 
 		 394 aa  108  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  27.71 
 
 		 407 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  25.39 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  28.57 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  29.18 
 
 		 412 aa  106  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  28.54 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  28.54 
 
 		 388 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  25.63 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  25.94 
 
 		 409 aa  104  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  26.09 
 
 		 407 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  26.29 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  29.44 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.64 
 
 		 363 aa  100  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  26.47 
 
 		 372 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.57 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.57 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  28.83 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  27.69 
 
 		 409 aa  96.7  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  27.66 
 
 		 383 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  24.94 
 
 		 372 aa  95.9  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  25.62 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  28.17 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  26.17 
 
 		 422 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  26.79 
 
 		 383 aa  94  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  25.2 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  27.36 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  30.05 
 
 		 375 aa  92  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  26.6 
 
 		 415 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  24.12 
 
 		 429 aa  89.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.24 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  28.72 
 
 		 401 aa  87.4  5e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  24.61 
 
 		 438 aa  87  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  26.09 
 
 		 436 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  26.89 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  24.87 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  27.44 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  26.75 
 
 		 376 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.09 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  26.52 
 
 		 418 aa  83.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  24.36 
 
 		 436 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  25 
 
 		 376 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  23.82 
 
 		 423 aa  81.3  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  26.75 
 
 		 376 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  26.32 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  25.77 
 
 		 428 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  24.94 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  23.51 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  31.71 
 
 		 402 aa  76.3  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  27.83 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  27.06 
 
 		 388 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  27.16 
 
 		 376 aa  75.5  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  24.81 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  25.8 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  24.88 
 
 		 743 aa  73.6  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  26.09 
 
 		 376 aa  73.6  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  26.95 
 
 		 378 aa  72.8  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  27.14 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  25.48 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  26.33 
 
 		 376 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  27.88 
 
 		 412 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  30.8 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  26.3 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  23.41 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  24.14 
 
 		 401 aa  56.2  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3315  hypothetical protein  30.57 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1181  hypothetical protein  29.06 
 
 		 464 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.415586  normal  0.738577 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0166  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.37 
 
 		 407 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.53 
 
 		 422 aa  52.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  25 
 
 		 396 aa  51.2  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3277  peptidase M20:peptidase dimerisation  27.18 
 
 		 422 aa  50.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  24.91 
 
 		 368 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0219  peptidase dimerization domain protein  25.26 
 
 		 384 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176401  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0424  M20/DapE family protein YgeY  24.89 
 
 		 413 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.77 
 
 		 389 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  22.6 
 
 		 422 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  27.27 
 
 		 396 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  34.07 
 
 		 394 aa  47.4  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1098  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.09 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.975986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  30.97 
 
 		 440 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  30.53 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1663  M20/DapE family protein YgeY  24.59 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3383  hypothetical protein  32.26 
 
 		 463 aa  45.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>