274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2667 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  100 
 
 
461 aa  912    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  66.67 
 
 
452 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  64 
 
 
454 aa  521  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  45.71 
 
 
402 aa  330  3e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  37.73 
 
 
440 aa  273  6e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  38.27 
 
 
453 aa  263  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  40.21 
 
 
403 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  38.44 
 
 
417 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  36.57 
 
 
361 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  32.26 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  30.51 
 
 
337 aa  108  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  28.13 
 
 
389 aa  101  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  30.36 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  26.41 
 
 
368 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  28.44 
 
 
394 aa  77  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  24.55 
 
 
389 aa  77  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  24.87 
 
 
374 aa  77  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  25.65 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  26.77 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  26.48 
 
 
410 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  27.48 
 
 
408 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.57 
 
 
375 aa  67.4  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.73 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  25.07 
 
 
378 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  25.27 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  32.65 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  26.11 
 
 
376 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  27.17 
 
 
409 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  27.7 
 
 
413 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  25.56 
 
 
413 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  27.57 
 
 
370 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  26.54 
 
 
377 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  26.54 
 
 
377 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  22.59 
 
 
383 aa  65.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  28.42 
 
 
376 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  28 
 
 
377 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0773  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 
359 aa  65.1  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.743362  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  26.41 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  27.51 
 
 
432 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  29.89 
 
 
416 aa  64.7  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.7 
 
 
376 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  26.56 
 
 
383 aa  63.2  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  31.75 
 
 
385 aa  62.4  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  29.65 
 
 
412 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.55 
 
 
358 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  27.5 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.55 
 
 
358 aa  61.6  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  27.82 
 
 
376 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  25.48 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  29.31 
 
 
377 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.9 
 
 
354 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.79 
 
 
405 aa  60.5  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3022  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.88 
 
 
351 aa  60.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.654756  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.18 
 
 
368 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  25.91 
 
 
385 aa  60.5  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  27.17 
 
 
415 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.15 
 
 
394 aa  60.1  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8429  dipeptidase  28.57 
 
 
353 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  27.89 
 
 
376 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.98 
 
 
378 aa  59.7  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  28.21 
 
 
429 aa  59.7  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.54 
 
 
371 aa  59.7  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  29.88 
 
 
375 aa  58.9  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  23.77 
 
 
375 aa  59.3  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  26.48 
 
 
391 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  25.62 
 
 
383 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.49 
 
 
378 aa  58.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  29.3 
 
 
399 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.86 
 
 
368 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  27.31 
 
 
376 aa  58.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.37 
 
 
368 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3942  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.02 
 
 
361 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0243581 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2278  acetylornithine deacetylase  24.81 
 
 
422 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  24.81 
 
 
422 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  29.95 
 
 
376 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25960  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.51 
 
 
359 aa  57.4  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129356  normal  0.963419 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  27.86 
 
 
375 aa  57.4  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  24.24 
 
 
374 aa  57  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  23.97 
 
 
374 aa  56.6  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  24.65 
 
 
372 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  24.65 
 
 
372 aa  56.6  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2076  acetylornithine deacetylase  24.03 
 
 
422 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  24.65 
 
 
372 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  24.65 
 
 
372 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  39.18 
 
 
394 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  24.65 
 
 
372 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  24.65 
 
 
372 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  24.3 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2331  acetylornithine deacetylase  24.03 
 
 
422 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.055832  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  24.81 
 
 
410 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0916  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.13 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  25.9 
 
 
441 aa  55.8  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  26.46 
 
 
360 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  26.65 
 
 
372 aa  55.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0771  peptidase M20:peptidase M20  26.46 
 
 
380 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  30.16 
 
 
382 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  27.54 
 
 
385 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.04 
 
 
374 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1200  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.89 
 
 
354 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  24.73 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>