142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3913 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  100 
 
 		 440 aa  902    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  55.1 
 
 		 453 aa  478  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  38.21 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  40.4 
 
 		 402 aa  283  6.000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  40.79 
 
 		 452 aa  268  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  39.26 
 
 		 454 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  37.25 
 
 		 403 aa  232  8.000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  35.51 
 
 		 417 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  36.02 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  31.92 
 
 		 344 aa  125  1e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  33.43 
 
 		 337 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  26.05 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  23.88 
 
 		 389 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  25.63 
 
 		 377 aa  76.3  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  26.54 
 
 		 372 aa  75.5  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  32.32 
 
 		 441 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  24.36 
 
 		 372 aa  69.7  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  24.78 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  24.3 
 
 		 374 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  23.26 
 
 		 368 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.63 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  27.93 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  24.92 
 
 		 374 aa  62  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  25.79 
 
 		 407 aa  60.1  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  23.76 
 
 		 407 aa  59.3  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.29 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  25.27 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  22.4 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  23.64 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.11 
 
 		 349 aa  56.6  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  25.08 
 
 		 409 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  26.61 
 
 		 436 aa  55.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.25 
 
 		 363 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  30 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  30 
 
 		 382 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  29.85 
 
 		 382 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  23.6 
 
 		 379 aa  53.9  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  26.7 
 
 		 391 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  25 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  26.39 
 
 		 394 aa  53.5  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  26.87 
 
 		 401 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  26.32 
 
 		 377 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  23.61 
 
 		 376 aa  53.1  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  25.53 
 
 		 402 aa  53.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  32.8 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  22.97 
 
 		 368 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  25 
 
 		 385 aa  52.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  24.21 
 
 		 374 aa  52  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  23.68 
 
 		 370 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.78 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  24.07 
 
 		 381 aa  52.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  24.19 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  26.2 
 
 		 402 aa  50.8  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.98 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1646  peptidase  22.31 
 
 		 401 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.017723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.29 
 
 		 354 aa  50.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  29.61 
 
 		 383 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  26.21 
 
 		 389 aa  50.1  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  25 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1114  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.65 
 
 		 429 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  26.64 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  32.46 
 
 		 409 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.03 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  24.32 
 
 		 368 aa  49.3  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  27.55 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  24.42 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  22.67 
 
 		 383 aa  49.3  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  26.33 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0324  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.35 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1035  peptidase dimerisation domain protein  32.06 
 
 		 424 aa  48.1  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12668  aminoacyl-histidine dipeptidase  26.22 
 
 		 487 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  24.3 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.36 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  25.18 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0998  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.73 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  26.15 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  26.15 
 
 		 388 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  21.68 
 
 		 402 aa  47.4  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  25.43 
 
 		 368 aa  47.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  26.87 
 
 		 424 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  26.9 
 
 		 377 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  26.9 
 
 		 377 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  22.41 
 
 		 365 aa  47.4  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  30.97 
 
 		 432 aa  47  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1080  acetylornithine deacetylase  24.05 
 
 		 430 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  27.9 
 
 		 383 aa  47  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.42 
 
 		 368 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2784  peptidase M20  28.34 
 
 		 394 aa  47  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2525  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.67 
 
 		 378 aa  46.6  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.09 
 
 		 368 aa  46.6  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  24.18 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  26.33 
 
 		 383 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0467  acetylornithine deacetylase  30.07 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0406  acetylornithine deacetylase  30.07 
 
 		 424 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  26 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  30.07 
 
 		 426 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  22.12 
 
 		 398 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3442  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.63 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2115  acetylornithine deacetylase  25.38 
 
 		 422 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.496864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  27.04 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>