226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5278 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  100 
 
 		 454 aa  908    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  64 
 
 		 461 aa  543  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  67.3 
 
 		 452 aa  528  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  42.71 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  38.55 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  37.7 
 
 		 453 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  41.21 
 
 		 403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  35.29 
 
 		 417 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  35.21 
 
 		 361 aa  169  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  29.81 
 
 		 344 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  30.32 
 
 		 337 aa  101  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  29.73 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  26.84 
 
 		 374 aa  89.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  27.72 
 
 		 372 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  25.72 
 
 		 368 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  26.55 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  26.55 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  25.99 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  23.73 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  27.95 
 
 		 383 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  25.45 
 
 		 383 aa  72.8  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  27.8 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  27.01 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  24.66 
 
 		 376 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  27.81 
 
 		 372 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  25.31 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  23.88 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  27.03 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  35.92 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  28.21 
 
 		 372 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.27 
 
 		 394 aa  64.7  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  25.63 
 
 		 374 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  26.37 
 
 		 408 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  24.62 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  24.66 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25.21 
 
 		 375 aa  63.5  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  24.06 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  26.5 
 
 		 382 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  25.06 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  27.96 
 
 		 375 aa  63.2  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  27.07 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.6 
 
 		 405 aa  63.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  25.28 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  25.98 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  28.39 
 
 		 377 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  25.98 
 
 		 372 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  25.75 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  26.39 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  25.55 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  26.68 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  26.06 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  24.79 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  28.05 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  25.27 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  23.73 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  23.5 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  25.4 
 
 		 368 aa  60.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  25.72 
 
 		 372 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  25.72 
 
 		 372 aa  59.7  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  26.27 
 
 		 413 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0410  acetylornithine deacetylase  24.7 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  25.2 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  25.2 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  25.2 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  25.2 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  25.2 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  25.2 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  30.56 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  25.52 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  26.52 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  24.43 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  26.71 
 
 		 388 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0475  acetylornithine deacetylase  24.47 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  25.95 
 
 		 413 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2769  peptidase M20  27.21 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.728292  normal  0.0329756 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  29.55 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  23.59 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  26.22 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  23.59 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  29 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4825  acetylornithine deacetylase  24.47 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0895557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  26.25 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  23.39 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.73 
 
 		 354 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  28.21 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.86 
 
 		 363 aa  56.2  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  27.19 
 
 		 374 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  27.44 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1500  peptidase  22.99 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.42 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.16 
 
 		 402 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  23.85 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  27.21 
 
 		 381 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  24.27 
 
 		 368 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  27.47 
 
 		 441 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  26.2 
 
 		 394 aa  55.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0548  acetylornithine deacetylase  24.58 
 
 		 424 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.166552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0710  peptidase  24.69 
 
 		 394 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00268178  normal  0.0281992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  26.62 
 
 		 383 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0493  acetylornithine deacetylase  24.11 
 
 		 426 aa  54.3  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>