262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0276 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  100 
 
 		 361 aa  700    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  45.48 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  41.79 
 
 		 337 aa  212  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  40.62 
 
 		 344 aa  209  9e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  39.71 
 
 		 402 aa  206  5e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  36.57 
 
 		 461 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  35.14 
 
 		 452 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  35.92 
 
 		 417 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  35.89 
 
 		 440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  34.29 
 
 		 453 aa  163  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  35.38 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  27.02 
 
 		 389 aa  113  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  27.56 
 
 		 374 aa  85.9  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  27.88 
 
 		 374 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  28.85 
 
 		 376 aa  83.2  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  25 
 
 		 377 aa  69.7  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  28.85 
 
 		 383 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  22.88 
 
 		 370 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  36.74 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2083  acetylornithine deacetylase  27.73 
 
 		 388 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151989  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0323  acetylornithine deacetylase  28.73 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2045  acetylornithine deacetylase  28.93 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.536708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  23.84 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4061  acetylornithine deacetylase  26.42 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4252  acetylornithine deacetylase  27.27 
 
 		 383 aa  66.2  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.167911  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  28.04 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  28.04 
 
 		 388 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  27.11 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5420  acetylornithine deacetylase  26.44 
 
 		 382 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00044  acetylornithine deacetylase  25.47 
 
 		 378 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0407  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.74 
 
 		 392 aa  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  26.23 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0253  acetylornithine deacetylase  28.1 
 
 		 395 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  31.43 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  23.91 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002311  acetylornithine deacetylase  25.2 
 
 		 378 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  24.09 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  31.39 
 
 		 376 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  24.1 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  24.78 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  23.97 
 
 		 385 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1359  acetylornithine deacetylase  25.78 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  26.4 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  23.7 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2221  acetylornithine deacetylase  25.47 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0456385  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3112  acetylornithine deacetylase (ArgE)  25.34 
 
 		 400 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.593604  normal  0.915795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  24.36 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  24.26 
 
 		 377 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  30 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  30.5 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4029  acetylornithine deacetylase  25.14 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.885326  normal  0.300617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  24.79 
 
 		 383 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.42 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2747  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.37 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  24.5 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  24.5 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  29.72 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  30.36 
 
 		 402 aa  58.9  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  24.5 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  24.5 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  24.5 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  24.5 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  28.97 
 
 		 376 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  29.84 
 
 		 383 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.71 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  24.84 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.71 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  23.97 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  23.97 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  24.72 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2918  peptidase M20  29.77 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  27.74 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  28.98 
 
 		 388 aa  57  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  23.12 
 
 		 372 aa  57  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  30.51 
 
 		 389 aa  56.6  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  24.41 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4496  acetylornithine deacetylase  24.72 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.815882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4029  acetylornithine deacetylase (ArgE)  24.72 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4317  acetylornithine deacetylase (ArgE)  27.58 
 
 		 388 aa  56.6  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.663035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4059  acetylornithine deacetylase  24.72 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0226  acetylornithine deacetylase  24.4 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.417629  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0126  acetylornithine deacetylase  25.08 
 
 		 389 aa  56.2  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4361  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 		 383 aa  56.2  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  28.4 
 
 		 380 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4090  acetylornithine deacetylase  25.08 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3899  acetylornithine deacetylase  25.08 
 
 		 387 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  29.64 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03842  acetylornithine deacetylase  24.72 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4404  acetylornithine deacetylase  25.21 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.268381 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4191  acetylornithine deacetylase  24.72 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  25.83 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1104  acetylornithine deacetylase  25.23 
 
 		 391 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.681147 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4451  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.600923  hitchhiker  0.000712813 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0363  acetylornithine deacetylase  24.48 
 
 		 387 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  22.79 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  24.46 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5417  acetylornithine deacetylase  25.21 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03791  hypothetical protein  24.72 
 
 		 383 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  28.28 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4330  acetylornithine deacetylase  25.98 
 
 		 383 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>