209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1442 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  100 
 
 
417 aa  839    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  39.05 
 
 
402 aa  267  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  38.05 
 
 
403 aa  240  4e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  34.73 
 
 
453 aa  237  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  38.44 
 
 
461 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  38.04 
 
 
452 aa  229  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  35.54 
 
 
440 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  35.29 
 
 
454 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  35.91 
 
 
361 aa  174  2.9999999999999996e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  31.75 
 
 
344 aa  160  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  31.31 
 
 
337 aa  132  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  25.78 
 
 
389 aa  106  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  27.61 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  25.74 
 
 
375 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  28.87 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  27.09 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  25.34 
 
 
383 aa  71.6  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  28.53 
 
 
376 aa  69.7  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  24.23 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  24.23 
 
 
388 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  23.63 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  26.59 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  26.52 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  26.19 
 
 
372 aa  67  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  25.83 
 
 
389 aa  66.6  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  25.48 
 
 
409 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  25.41 
 
 
377 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1297  peptidase M20  25.32 
 
 
434 aa  64.7  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0144616  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  27.13 
 
 
385 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.56 
 
 
376 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  25.25 
 
 
394 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  30 
 
 
377 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  25.72 
 
 
376 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  25.43 
 
 
365 aa  61.6  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  24.44 
 
 
378 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  23.96 
 
 
417 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  22.26 
 
 
364 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  25.35 
 
 
374 aa  60.1  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  26.77 
 
 
385 aa  60.1  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  28.37 
 
 
360 aa  59.7  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  26.86 
 
 
370 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  30.99 
 
 
410 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  26.69 
 
 
378 aa  58.9  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  23.77 
 
 
370 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  27.74 
 
 
412 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  23.48 
 
 
368 aa  57.8  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  23.99 
 
 
374 aa  57.4  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.43 
 
 
368 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.19 
 
 
396 aa  57  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  25.94 
 
 
376 aa  56.6  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.4 
 
 
405 aa  56.2  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  24.05 
 
 
377 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.36 
 
 
442 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  25.95 
 
 
409 aa  56.2  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  29.11 
 
 
372 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1541  peptidase M20  26.3 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  27.36 
 
 
372 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0233  peptidase M20  24.61 
 
 
420 aa  54.7  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.571831  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  25.62 
 
 
367 aa  54.7  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  25.09 
 
 
374 aa  54.7  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.78 
 
 
368 aa  54.3  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  27.21 
 
 
372 aa  54.3  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.37 
 
 
354 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.99 
 
 
358 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3650  acetylornithine deacetylase  26.85 
 
 
380 aa  54.3  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0499881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.99 
 
 
358 aa  54.3  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  24.24 
 
 
402 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  24.74 
 
 
374 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.01 
 
 
368 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3430  peptidase M20  25.87 
 
 
364 aa  53.9  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.413253 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  26.87 
 
 
394 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3695  acetylornithine deacetylase  26.38 
 
 
364 aa  53.5  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  23.72 
 
 
391 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.17 
 
 
363 aa  53.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  24.67 
 
 
369 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  24.84 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  24.86 
 
 
383 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  30.88 
 
 
382 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  31.65 
 
 
382 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  25.16 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  23.3 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  23.3 
 
 
377 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  25.62 
 
 
368 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  24.41 
 
 
429 aa  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  23.91 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  30.2 
 
 
382 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  27.53 
 
 
374 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  22.79 
 
 
416 aa  52.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  26.2 
 
 
374 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2755  acetylornithine deacetylase  27.78 
 
 
378 aa  52  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  24.86 
 
 
368 aa  52  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  25.84 
 
 
418 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3515  peptidase M20  25.93 
 
 
377 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  22.55 
 
 
413 aa  51.6  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  24.65 
 
 
379 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  26.97 
 
 
441 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0190  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.49 
 
 
381 aa  51.6  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2253  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  23.34 
 
 
414 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  24.6 
 
 
385 aa  50.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3899  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.9 
 
 
354 aa  50.4  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0558004  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>