162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3346 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  100 
 
 		 453 aa  920    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  55.1 
 
 		 440 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  40.91 
 
 		 402 aa  295  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  38.39 
 
 		 461 aa  276  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  41.8 
 
 		 452 aa  264  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  34.97 
 
 		 417 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  39.84 
 
 		 454 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  34.7 
 
 		 403 aa  224  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  34.58 
 
 		 361 aa  170  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  30.52 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  32.3 
 
 		 337 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  27.01 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  25.14 
 
 		 368 aa  72  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1676  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.84 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1296  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  28.63 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  28.57 
 
 		 408 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  25.42 
 
 		 374 aa  67  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  25.08 
 
 		 374 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  25.73 
 
 		 405 aa  64.7  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.87 
 
 		 429 aa  63.9  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4723  peptidase M20  32.99 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.454685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  20.3 
 
 		 389 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  25.98 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  25.8 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1394  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  31.47 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1861  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  29.74 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  26.28 
 
 		 372 aa  60.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  24.76 
 
 		 376 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  25.08 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  25.42 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  27.95 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  25.15 
 
 		 416 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.04 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  26.54 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0255  peptidase M20  25.91 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  25.38 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3969  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.03 
 
 		 368 aa  57  0.0000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  24.69 
 
 		 411 aa  56.6  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3891  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.03 
 
 		 368 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.909274  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  25.7 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3828  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.48 
 
 		 368 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  23.85 
 
 		 375 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1704  peptidase M20  22.22 
 
 		 369 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  24.44 
 
 		 378 aa  55.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  28.04 
 
 		 377 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  23.74 
 
 		 376 aa  55.1  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1259  acetylornithine deacetylase / N2-acetyl-L-lysine deacetylase  29.46 
 
 		 335 aa  55.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3929  peptidase M20  24.38 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.856117  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0238  peptidase M20  26.53 
 
 		 436 aa  54.3  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  24.34 
 
 		 372 aa  54.3  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  28.03 
 
 		 410 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  24.49 
 
 		 372 aa  53.5  0.000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3180  peptidase M20  23.47 
 
 		 364 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.689816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  25.47 
 
 		 413 aa  53.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  23.29 
 
 		 389 aa  53.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12668  aminoacyl-histidine dipeptidase  27.17 
 
 		 487 aa  53.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1641  acetylornithine deacetylase  27.37 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.204001 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  27.92 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0867  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  27.76 
 
 		 338 aa  52.4  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1905  acetylornithine deacetylase  24.84 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119437  normal  0.233853 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  27.92 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  24.84 
 
 		 403 aa  51.6  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  27.92 
 
 		 382 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0072  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  21.67 
 
 		 354 aa  51.2  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  21.47 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  25.08 
 
 		 376 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0537  aminoacyl-histidine dipeptidase  23.84 
 
 		 486 aa  50.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  23.7 
 
 		 388 aa  50.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  24.66 
 
 		 416 aa  50.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0282  aminoacyl-histidine dipeptidase  24.61 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.447065 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  25.89 
 
 		 385 aa  50.4  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0291  aminoacyl-histidine dipeptidase  24.61 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0453943 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0234  aminoacyl-histidine dipeptidase  24.61 
 
 		 485 aa  50.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3290  aminoacyl-histidine dipeptidase  24.41 
 
 		 486 aa  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  25.35 
 
 		 438 aa  50.4  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  24.57 
 
 		 428 aa  50.4  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2400  aminoacyl-histidine dipeptidase  26.15 
 
 		 486 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233033  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1576  acetylornithine deacetylase  24.28 
 
 		 397 aa  50.1  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.398543  normal  0.0213097 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3344  aminoacyl-histidine dipeptidase  24.61 
 
 		 485 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00232  aminoacyl-histidine dipeptidase (peptidase D)  24.61 
 
 		 485 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00235  hypothetical protein  24.61 
 
 		 485 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  24.13 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  25.08 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  24.44 
 
 		 376 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0264  aminoacyl-histidine dipeptidase  24.61 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0269  aminoacyl-histidine dipeptidase  24.61 
 
 		 485 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2053  aminoacyl-histidine dipeptidase  27.54 
 
 		 484 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3370  aminoacyl-histidine dipeptidase  24.28 
 
 		 485 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1843  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.75 
 
 		 375 aa  48.9  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230632  normal  0.0555085 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15460  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.56 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.213876  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  26.58 
 
 		 365 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  23.33 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.34 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  23.42 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  23.42 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  23.42 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  23.42 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  23.42 
 
 		 405 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  23.42 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  26.36 
 
 		 368 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>