251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0805 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  100 
 
 
344 aa  683    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  63.25 
 
 
337 aa  409  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  40.62 
 
 
361 aa  209  8e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  37.73 
 
 
403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  33.14 
 
 
402 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  30.86 
 
 
417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  29.97 
 
 
453 aa  135  8e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  32.26 
 
 
461 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  31.09 
 
 
452 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  31.07 
 
 
440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  29.33 
 
 
454 aa  107  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  30.07 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  29.17 
 
 
360 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  26.12 
 
 
368 aa  76.3  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.59 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  28.08 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  22.71 
 
 
389 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  24.45 
 
 
383 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  25.08 
 
 
368 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  25.61 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  23.35 
 
 
370 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  23.2 
 
 
391 aa  65.5  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  24.6 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  24.6 
 
 
377 aa  64.7  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  25.95 
 
 
409 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  24.04 
 
 
368 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4616  peptidase M20  31.17 
 
 
378 aa  63.5  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  27.15 
 
 
394 aa  63.2  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  24.68 
 
 
368 aa  63.2  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  26.99 
 
 
383 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  23.68 
 
 
375 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  29.81 
 
 
367 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  28.36 
 
 
409 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  25.97 
 
 
377 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  25.68 
 
 
385 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4508  acetylornithine deacetylase  24.93 
 
 
374 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  25.22 
 
 
376 aa  60.5  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  28.08 
 
 
402 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  31.1 
 
 
426 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2805  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.71 
 
 
374 aa  60.5  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0351363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  25.07 
 
 
375 aa  59.7  0.00000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2765  amidohydrolase  26.84 
 
 
423 aa  59.3  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0277  acetylornithine deacetylase  25.4 
 
 
380 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.989637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0983  acetylornithine deacetylase  22.46 
 
 
381 aa  59.3  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  23.16 
 
 
365 aa  58.9  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  26.03 
 
 
383 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5246  acetylornithine deacetylase  25.08 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  27.59 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  27.59 
 
 
388 aa  57.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  24.78 
 
 
377 aa  57  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  26.69 
 
 
416 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  29.01 
 
 
377 aa  57  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3558  acetylornithine deacetylase  22.12 
 
 
387 aa  56.6  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  27.24 
 
 
413 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  24.93 
 
 
372 aa  56.6  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  26.36 
 
 
417 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0255  acetylornithine deacetylase  21.56 
 
 
383 aa  56.6  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0256  acetylornithine deacetylase  26.08 
 
 
385 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  22.22 
 
 
341 aa  56.2  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 
384 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.7 
 
 
358 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  24.7 
 
 
358 aa  56.2  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3269  acetylornithine deacetylase  25.71 
 
 
382 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0376318 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0317  N-acetyl-ornithine/N-acetyl-lysine deacetylase  25 
 
 
348 aa  55.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  26.01 
 
 
413 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  27.44 
 
 
424 aa  55.1  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1186  M20/M25/M40 family peptidase  23.81 
 
 
363 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390537  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5093  acetylornithine deacetylase  24.76 
 
 
380 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1391  acetyl-lysine deacetylase  36.23 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.971431  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  26.75 
 
 
384 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  22.26 
 
 
374 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  25.4 
 
 
415 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0495  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.46 
 
 
354 aa  54.3  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  25.93 
 
 
409 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  27.46 
 
 
412 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0377  peptidase M20  28.06 
 
 
367 aa  53.9  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  22.93 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  24.69 
 
 
372 aa  53.9  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  22.12 
 
 
374 aa  53.9  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  30.57 
 
 
409 aa  53.9  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5186  acetylornithine deacetylase  24.44 
 
 
380 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  24.84 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  24.23 
 
 
407 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  25.94 
 
 
376 aa  53.5  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  26.12 
 
 
410 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  26.69 
 
 
408 aa  53.1  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  26.74 
 
 
374 aa  53.1  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5500  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.25 
 
 
358 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.230023  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  27.42 
 
 
429 aa  52.8  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  25.07 
 
 
432 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2044  acetylornithine deacetylase  21.87 
 
 
392 aa  52.8  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.234319  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1544  acetylornithine deacetylase  26.11 
 
 
374 aa  51.6  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.88458  normal  0.449301 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0661  peptidase M20  30.11 
 
 
344 aa  51.2  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  27.15 
 
 
382 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1546  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.21 
 
 
399 aa  52  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00241129 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  27.61 
 
 
389 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2738  peptidase M20  27.78 
 
 
360 aa  50.8  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  26.82 
 
 
382 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0190  acetylornithine deacetylase  21.75 
 
 
383 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00904916  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7482  allantoate amidohydrolase  26.09 
 
 
431 aa  50.8  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0271426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>