More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003656 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  92.92 
 
 		 368 aa  697    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  100 
 
 		 368 aa  749    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  75.97 
 
 		 368 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  70.49 
 
 		 391 aa  534  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  69.67 
 
 		 368 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  68.03 
 
 		 381 aa  511  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  50.14 
 
 		 372 aa  338  8e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  42.9 
 
 		 368 aa  312  5.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  46.01 
 
 		 375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  45.05 
 
 		 377 aa  293  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  42.74 
 
 		 368 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  43.87 
 
 		 368 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  43.58 
 
 		 370 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  45.07 
 
 		 372 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  42.66 
 
 		 377 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  43.92 
 
 		 372 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  43.37 
 
 		 374 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  43.96 
 
 		 372 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  43.68 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  43.68 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  43.68 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  43.68 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  43.68 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  43.68 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  43.68 
 
 		 372 aa  262  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  43.68 
 
 		 372 aa  262  8e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  43.96 
 
 		 372 aa  261  2e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  42.47 
 
 		 374 aa  261  2e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  39.29 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  41.76 
 
 		 368 aa  258  1e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  43.09 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  39.4 
 
 		 376 aa  251  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  40.82 
 
 		 370 aa  244  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  38.89 
 
 		 378 aa  242  7e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  39.67 
 
 		 374 aa  236  3e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  39.84 
 
 		 379 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  37.85 
 
 		 375 aa  232  8.000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  38.7 
 
 		 365 aa  229  4e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  37.15 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  37.15 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  37.81 
 
 		 389 aa  228  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  33.7 
 
 		 383 aa  193  4e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  34.84 
 
 		 387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  31.11 
 
 		 402 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  30.03 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  27.81 
 
 		 401 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  27.52 
 
 		 415 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  28.27 
 
 		 391 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  25.84 
 
 		 414 aa  94.7  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  27.79 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  24.26 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  24.32 
 
 		 423 aa  90.5  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  30.04 
 
 		 411 aa  89.7  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  24.3 
 
 		 410 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  30.47 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  25.2 
 
 		 414 aa  86.3  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.74 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  25.63 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1755  peptidase M20  24.04 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  26.67 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  26.68 
 
 		 410 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  24.32 
 
 		 410 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  28.1 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  24.11 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  24.51 
 
 		 422 aa  84.3  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  25.36 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  23.21 
 
 		 423 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  24.11 
 
 		 411 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  24.11 
 
 		 411 aa  83.6  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  26.68 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  28.73 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  28.62 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  27.84 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  29.26 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  27.9 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  27.02 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  24.64 
 
 		 410 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  24.69 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  26.84 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  24.69 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  24.69 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  24.69 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  25.12 
 
 		 410 aa  79.3  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  26.63 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  26.63 
 
 		 388 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  24.69 
 
 		 408 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  25.18 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  24.69 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  27.09 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  26.21 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  24.69 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  24.56 
 
 		 410 aa  79.3  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  24.69 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  23.81 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  24.65 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  27.38 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  25.49 
 
 		 410 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  28.13 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  28.04 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0150  acetylornithine deacetylase  25.45 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>