155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1712 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01125  peptidase T  76.9 
 
 		 408 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  76.9 
 
 		 408 aa  676    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  80.93 
 
 		 423 aa  718    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  79.71 
 
 		 410 aa  712    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  77.15 
 
 		 422 aa  679    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  76.72 
 
 		 422 aa  679    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  76.9 
 
 		 408 aa  677    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  99.76 
 
 		 411 aa  850    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  76.9 
 
 		 408 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  77.15 
 
 		 409 aa  679    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  78.97 
 
 		 423 aa  703    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  80.44 
 
 		 409 aa  718    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  99.76 
 
 		 411 aa  852    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  79.22 
 
 		 410 aa  700    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  100 
 
 		 411 aa  856    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  76.9 
 
 		 408 aa  677    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  77.15 
 
 		 422 aa  679    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  76.9 
 
 		 408 aa  674    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  76.53 
 
 		 409 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  76.53 
 
 		 409 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  76.77 
 
 		 409 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  76.77 
 
 		 409 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  76.53 
 
 		 409 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  58.82 
 
 		 413 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  59.51 
 
 		 412 aa  514  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  60.1 
 
 		 410 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  55.67 
 
 		 407 aa  480  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  57.49 
 
 		 409 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  54.88 
 
 		 409 aa  477  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  55.06 
 
 		 410 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  54.39 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  53.79 
 
 		 410 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  55.28 
 
 		 409 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  54.28 
 
 		 407 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  53.17 
 
 		 425 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  54.28 
 
 		 408 aa  439  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  52.45 
 
 		 415 aa  440  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  51.96 
 
 		 406 aa  431  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  52.45 
 
 		 406 aa  434  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  52.81 
 
 		 414 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  51.72 
 
 		 410 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  51.96 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  51.34 
 
 		 407 aa  427  1e-118  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  51.96 
 
 		 410 aa  426  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  53.06 
 
 		 410 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  51.47 
 
 		 410 aa  421  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  51.72 
 
 		 410 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  51.72 
 
 		 410 aa  424  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3488  peptidase T  50.98 
 
 		 410 aa  419  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3500  peptidase T  51.23 
 
 		 412 aa  421  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3754  peptidase T  50.86 
 
 		 410 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000202819 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  50.86 
 
 		 410 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  50.86 
 
 		 410 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  49.14 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  49.14 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1942  peptidase T  48.31 
 
 		 417 aa  398  1e-109  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.366024  normal  0.129304 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0925  peptidase T  51.23 
 
 		 401 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000393366  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0445  peptidase T  50.12 
 
 		 405 aa  387  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0466341 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0410  peptidase T  47.9 
 
 		 412 aa  383  1e-105  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.88832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0772  peptidase T  49.02 
 
 		 411 aa  382  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.340472  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1094  peptidase T  50 
 
 		 407 aa  382  1e-105  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.357945  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  48.76 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1996  peptidase T  47.57 
 
 		 413 aa  369  1e-101  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  47.92 
 
 		 402 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  44.79 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  48.04 
 
 		 406 aa  355  7.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1109  peptidase T  43.34 
 
 		 415 aa  345  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  43.03 
 
 		 411 aa  342  7e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  43.98 
 
 		 427 aa  335  7.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  43.52 
 
 		 417 aa  333  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  42.54 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  42.65 
 
 		 417 aa  333  5e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  42.3 
 
 		 410 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  42.16 
 
 		 430 aa  328  8e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  41.91 
 
 		 418 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  41.67 
 
 		 420 aa  327  3e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  42.65 
 
 		 427 aa  324  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  42.79 
 
 		 408 aa  321  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  41.81 
 
 		 417 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0998  peptidase T  41.99 
 
 		 407 aa  314  9.999999999999999e-85  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  42.01 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  41.75 
 
 		 425 aa  313  3.9999999999999997e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  41.52 
 
 		 422 aa  310  4e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  41.42 
 
 		 417 aa  308  8e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  41.03 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0953  peptidase T  40.53 
 
 		 416 aa  301  1e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  39.61 
 
 		 420 aa  298  1e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  39.42 
 
 		 415 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  38.97 
 
 		 420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  38.82 
 
 		 414 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  37.99 
 
 		 418 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1976  peptidase T  37.93 
 
 		 409 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.371679  normal  0.99083 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  36.27 
 
 		 411 aa  266  5e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  36.79 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  36.36 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0680  peptidase T  36.19 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0749  peptidase T  36.12 
 
 		 410 aa  260  3e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372662  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2412  peptidase T  36.62 
 
 		 416 aa  259  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2506  peptidase T  35.28 
 
 		 413 aa  259  8e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3359  peptidase T  35.38 
 
 		 410 aa  256  7e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>