157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0648 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  100 
 
 		 415 aa  852    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  49.27 
 
 		 414 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  47.77 
 
 		 430 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  47.41 
 
 		 427 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  47.15 
 
 		 417 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  46.55 
 
 		 417 aa  367  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  47.52 
 
 		 420 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  46.17 
 
 		 418 aa  360  2e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  45.36 
 
 		 411 aa  357  9.999999999999999e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  47.54 
 
 		 417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  46.55 
 
 		 417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  46.52 
 
 		 410 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  46.27 
 
 		 410 aa  355  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  47.51 
 
 		 411 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  43.64 
 
 		 410 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  47.57 
 
 		 427 aa  345  8e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  45.05 
 
 		 412 aa  345  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  43.97 
 
 		 420 aa  341  1e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  42.29 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  42.72 
 
 		 422 aa  331  1e-89  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  44.7 
 
 		 410 aa  331  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  41.58 
 
 		 415 aa  329  5.0000000000000004e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  42.68 
 
 		 414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  40.99 
 
 		 407 aa  325  7e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  42.5 
 
 		 410 aa  322  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  42.29 
 
 		 410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  42.29 
 
 		 410 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  40.45 
 
 		 408 aa  320  3e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  42.29 
 
 		 410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3754  peptidase T  41.79 
 
 		 410 aa  318  7.999999999999999e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000202819 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3488  peptidase T  41.54 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  42.04 
 
 		 410 aa  317  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  42.04 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  41.54 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3500  peptidase T  41.79 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  41.54 
 
 		 410 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0445  peptidase T  43.03 
 
 		 405 aa  315  7e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0466341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  40.1 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  41.67 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  40.1 
 
 		 406 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  42.08 
 
 		 413 aa  308  9e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1996  peptidase T  40.9 
 
 		 413 aa  306  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  40.2 
 
 		 407 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  42.82 
 
 		 412 aa  306  6e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  38.52 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  41.36 
 
 		 409 aa  300  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1942  peptidase T  41.63 
 
 		 417 aa  300  4e-80  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.366024  normal  0.129304 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  40.89 
 
 		 408 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  40.89 
 
 		 408 aa  299  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1094  peptidase T  42.82 
 
 		 407 aa  299  7e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.357945  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  39.21 
 
 		 402 aa  297  2e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  40.45 
 
 		 409 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  39.8 
 
 		 422 aa  294  2e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  40.69 
 
 		 409 aa  293  3e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  40.98 
 
 		 423 aa  291  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0772  peptidase T  40.59 
 
 		 411 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.340472  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  39.42 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  39.42 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  39.31 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  39.31 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  39.31 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  39.31 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  39.31 
 
 		 408 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  39.31 
 
 		 409 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  39.25 
 
 		 410 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0925  peptidase T  39.3 
 
 		 401 aa  289  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000393366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  40.05 
 
 		 410 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  39.31 
 
 		 408 aa  289  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  38.37 
 
 		 406 aa  288  8e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0998  peptidase T  40.15 
 
 		 407 aa  288  1e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  39.56 
 
 		 410 aa  288  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0410  peptidase T  40.05 
 
 		 412 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.88832  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  39.27 
 
 		 423 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  40.49 
 
 		 410 aa  285  9e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  39.42 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  39.42 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  39.42 
 
 		 411 aa  284  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  39.22 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  39.8 
 
 		 409 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  39.8 
 
 		 409 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  39.56 
 
 		 409 aa  282  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  39.8 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  39.8 
 
 		 409 aa  281  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1109  peptidase T  38.69 
 
 		 415 aa  274  2.0000000000000002e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  37.32 
 
 		 416 aa  268  1e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  37.56 
 
 		 411 aa  264  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  34.88 
 
 		 425 aa  260  2e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0680  peptidase T  36.54 
 
 		 410 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0749  peptidase T  36.32 
 
 		 410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372662  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  37.38 
 
 		 420 aa  253  5.000000000000001e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2931  peptidase T  36.71 
 
 		 409 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2412  peptidase T  36.8 
 
 		 416 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3359  peptidase T  35.82 
 
 		 410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  36.74 
 
 		 406 aa  243  5e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5411  peptidase T  35.02 
 
 		 414 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.683579  normal  0.180292 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  34.15 
 
 		 414 aa  242  7e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5042  peptidase T  35.02 
 
 		 414 aa  242  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.918686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2506  peptidase T  34.22 
 
 		 413 aa  237  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3612  peptidase T  37.56 
 
 		 407 aa  232  9e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0032561  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  31.77 
 
 		 407 aa  231  1e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>