More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5236 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5236  peptidase M20  100 
 
 		 403 aa  814    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1507  peptidase M20  56.03 
 
 		 402 aa  458  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3698  putative peptidase  55.5 
 
 		 401 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.704745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0918  peptidase M20  32.82 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400462  unclonable  4.70833e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  30.99 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  33.25 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3034  peptidase T-like protein  33.42 
 
 		 374 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000138199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  33.69 
 
 		 360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  32.13 
 
 		 368 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  31.23 
 
 		 372 aa  164  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1092  peptidase T-like protein  32.34 
 
 		 377 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00341854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2046  peptidase T-like protein  32.11 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3985  peptidase T-like protein  34.97 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1570  peptidase T-like protein  31.18 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1602  peptidase T-like protein  31.18 
 
 		 377 aa  160  4e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.438346  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0957  peptidase T-like protein  33.69 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000302106  hitchhiker  0.000000131493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4216  peptidase T  34.46 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00206895  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4257  peptidase, M20/M25/M40 family  34.46 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0980324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0978  peptidase, M20/M25/M40 family  34.46 
 
 		 372 aa  159  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0959  M20A family peptidase  30.55 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4052  peptidase T  34.2 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3891  peptidase T  34.2 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3898  peptidase T  34.2 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2841  peptidase T-like protein  33.94 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4368  peptidase T  34.2 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4278  peptidase, M20/M25/M40 family  34.2 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0679847  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4167  peptidase, M20/M25/M40 family  34.2 
 
 		 372 aa  157  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0101  peptidase  28.88 
 
 		 391 aa  156  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2277  peptidase T-like protein  28.88 
 
 		 370 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00122308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0323  peptidase T-like protein  32.63 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2283  peptidase T-like protein  32.72 
 
 		 372 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00606916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  32.88 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  30.26 
 
 		 377 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2778  peptidase T-like protein  30.59 
 
 		 372 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2568  peptidase T-like protein  32.25 
 
 		 376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00779474  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0298  peptidase T-like protein  28.99 
 
 		 368 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000204223  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3276  peptidase T-like protein  29.27 
 
 		 381 aa  145  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3656  tripeptidase T  28.18 
 
 		 368 aa  144  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003656  peptidase M20A family  30.03 
 
 		 368 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02174  tripeptidase T  29.95 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  28.92 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2471  peptidase T  30.73 
 
 		 378 aa  133  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00972327  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  27.61 
 
 		 374 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3485  peptidase T-like protein  27.84 
 
 		 368 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000911364  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2216  peptidase T-like protein  28.61 
 
 		 379 aa  91.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000147363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3087  peptidase dimerization domain protein  27.44 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  25.59 
 
 		 394 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  23.97 
 
 		 420 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  27.45 
 
 		 422 aa  74.7  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  23.21 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  24.82 
 
 		 427 aa  70.5  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  25.27 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  25.33 
 
 		 408 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3039  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.53 
 
 		 506 aa  68.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000107892  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  24.29 
 
 		 417 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  27.39 
 
 		 413 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2364  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.07 
 
 		 484 aa  66.6  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.043104 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0377  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.37 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000963652  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  24.87 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  24.87 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  24.87 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  24.87 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  24.87 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  24.87 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  24.87 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  24.87 
 
 		 408 aa  65.5  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12668  aminoacyl-histidine dipeptidase  32.9 
 
 		 487 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  26.32 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  27.13 
 
 		 413 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  22.89 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  24.66 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.37 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  26.1 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  23.8 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2053  aminoacyl-histidine dipeptidase  32.85 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  27.73 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  22.61 
 
 		 420 aa  63.2  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  25.52 
 
 		 409 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  24.63 
 
 		 376 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  27.7 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  25.65 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3612  peptidase T  25.48 
 
 		 407 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0032561  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  22.97 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  23.71 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0857  aminoacyl-histidine dipeptidase  29.85 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0171  peptidase M20  23.38 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.19921  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  25.37 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  25.42 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  25.14 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1584  aminoacyl-histidine dipeptidase  28.76 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  25.61 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1720  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  31.71 
 
 		 484 aa  60.1  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  26.1 
 
 		 376 aa  60.5  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1142  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.04 
 
 		 500 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0672748  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0537  aminoacyl-histidine dipeptidase  32.61 
 
 		 486 aa  59.7  0.00000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  25.34 
 
 		 407 aa  59.7  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  23.68 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  23.64 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0525  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  35.46 
 
 		 483 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1504  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  31.9 
 
 		 486 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>