151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1584 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1680  Pep581 peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M20C  73.96 
 
 		 484 aa  735    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0945346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1142  aminoacyl-histidine dipeptidase  67.77 
 
 		 500 aa  684    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1387  aminoacyl-histidine dipeptidase  67.84 
 
 		 493 aa  672    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0727929  unclonable  0.0000123065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1222  aminoacyl-histidine dipeptidase  66.87 
 
 		 486 aa  667    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.000871052 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1584  aminoacyl-histidine dipeptidase  100 
 
 		 488 aa  992    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0525  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  54.66 
 
 		 483 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2400  aminoacyl-histidine dipeptidase  51.85 
 
 		 486 aa  511  1e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233033  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12668  aminoacyl-histidine dipeptidase  52.56 
 
 		 487 aa  499  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2053  aminoacyl-histidine dipeptidase  51.36 
 
 		 484 aa  492  9.999999999999999e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0962  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.6 
 
 		 487 aa  486  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405496  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0180  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.86 
 
 		 487 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0948  M20C family Xaa-His dipeptidase  48.23 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0986  M20C family Xaa-His dipeptidase  48.23 
 
 		 487 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0950  M20C family Xaa-His dipeptidase  48.23 
 
 		 487 aa  483  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.478343  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0137  aminoacyl-histidine dipeptidase  50 
 
 		 484 aa  480  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.49846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2519  Xaa-His dipeptidase  48.23 
 
 		 486 aa  480  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3421  Xaa-His dipeptidase  47.71 
 
 		 486 aa  479  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.11643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1115  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.1 
 
 		 486 aa  477  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004273  aminoacyl-histidine dipeptidase (Peptidase D)  49.27 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1011  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  46.99 
 
 		 486 aa  475  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.855655  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0954  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.52 
 
 		 491 aa  477  1e-133  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0173315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01157  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.17 
 
 		 490 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3091  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.73 
 
 		 486 aa  472  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3603  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.19 
 
 		 497 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.905731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3350  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.11 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0940  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.9 
 
 		 486 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.282545  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2852  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.36 
 
 		 486 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.017395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1869  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.86 
 
 		 534 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.550605  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0973  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.59 
 
 		 484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3422  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.11 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3547  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.9 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0928  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.24 
 
 		 486 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2364  aminoacyl-histidine dipeptidase  50.31 
 
 		 484 aa  465  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.043104 
 
 
-
 
NC_002950  PG0537  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.92 
 
 		 486 aa  463  1e-129  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3156  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.72 
 
 		 486 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3295  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.93 
 
 		 486 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3290  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.6 
 
 		 486 aa  460  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3307  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.51 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00393893  hitchhiker  0.00000164378 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00232  aminoacyl-histidine dipeptidase (peptidase D)  47.41 
 
 		 485 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0895  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.35 
 
 		 486 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3344  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.62 
 
 		 485 aa  456  1e-127  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0346  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.65 
 
 		 485 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0296229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00235  hypothetical protein  47.41 
 
 		 485 aa  455  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0350  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.65 
 
 		 485 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0355  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.65 
 
 		 485 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0357  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.65 
 
 		 485 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000446766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3370  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.41 
 
 		 485 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0264  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.41 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0269  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.41 
 
 		 485 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0963  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.93 
 
 		 486 aa  452  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0282  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.41 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.447065 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0291  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.41 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0453943 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0234  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.41 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0365  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.65 
 
 		 485 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3437  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.6 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0763  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.88 
 
 		 485 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62172  normal  0.0792119 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0004  M20C family Xaa-His dipeptidase  44.26 
 
 		 486 aa  410  1e-113  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0857  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.36 
 
 		 484 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1504  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  43.89 
 
 		 486 aa  403  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2115  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.35 
 
 		 483 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2361  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.9 
 
 		 490 aa  402  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2403  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.35 
 
 		 483 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1744  aminoacyl-histidine dipeptidase  43.92 
 
 		 482 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3389  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.07 
 
 		 484 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00176848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1720  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  44.33 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0894  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.65 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.011645  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1035  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.68 
 
 		 485 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2957  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  42.94 
 
 		 487 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.974491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1798  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.2 
 
 		 484 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1877  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.23 
 
 		 484 aa  348  9e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.326174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2079  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  45.36 
 
 		 484 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2447  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.01 
 
 		 489 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1800  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.38 
 
 		 489 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2527  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.01 
 
 		 489 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2888  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.8 
 
 		 489 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120289  normal  0.458811 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2587  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.59 
 
 		 489 aa  338  9e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120702  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3039  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.35 
 
 		 506 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000107892  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2319  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.59 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2284  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.59 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00268357  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2514  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.59 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.411549 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2498  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.59 
 
 		 489 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2240  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.59 
 
 		 489 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0840688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2301  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.59 
 
 		 489 aa  329  9e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.280973  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2228  aminoacyl-histidine dipeptidase, putative  37.89 
 
 		 481 aa  325  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2963  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.11 
 
 		 487 aa  320  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000053786  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2512  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.22 
 
 		 483 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2216  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.6 
 
 		 483 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0150704  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0316  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.55 
 
 		 471 aa  311  2e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3149  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.79 
 
 		 476 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.35499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2796  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.18 
 
 		 486 aa  297  3e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000441457  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2706  aminoacyl-histidine dipeptidase  35 
 
 		 479 aa  293  4e-78  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.291599  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0622  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.23 
 
 		 476 aa  275  2.0000000000000002e-72  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.155688  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0516  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.41 
 
 		 492 aa  273  3e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3432  aminoacyl-histidine dipeptidase  31.62 
 
 		 487 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00107226  hitchhiker  0.000115392 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1343  Xaa-His dipeptidase  33.33 
 
 		 428 aa  189  8e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0999  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.33 
 
 		 422 aa  187  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.738378  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0809  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.54 
 
 		 422 aa  187  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.697451  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1062  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.54 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0116  aminoacyl-histidine dipeptidase  32.19 
 
 		 427 aa  179  9e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1073  aminoacyl-histidine dipeptidase  31.6 
 
 		 424 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>