137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2512 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2512  aminoacyl-histidine dipeptidase  100 
 
 
483 aa  981    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2216  aminoacyl-histidine dipeptidase  96.89 
 
 
483 aa  951    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0150704  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2403  aminoacyl-histidine dipeptidase  50.31 
 
 
483 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2115  aminoacyl-histidine dipeptidase  50.1 
 
 
483 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2527  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.86 
 
 
489 aa  472  1e-132  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2319  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.28 
 
 
489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2284  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.28 
 
 
489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00268357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2240  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.07 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0840688  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2498  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.28 
 
 
489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1800  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.77 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2514  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.28 
 
 
489 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.411549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2587  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.28 
 
 
489 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120702  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2228  aminoacyl-histidine dipeptidase, putative  48.76 
 
 
481 aa  464  1e-129  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2888  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.07 
 
 
489 aa  464  1e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120289  normal  0.458811 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2447  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.07 
 
 
489 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2706  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.54 
 
 
479 aa  459  9.999999999999999e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.291599  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2301  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.03 
 
 
489 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.280973  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3149  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.94 
 
 
476 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.35499  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2796  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.41 
 
 
486 aa  392  1e-108  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000441457  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0316  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.04 
 
 
471 aa  387  1e-106  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0537  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.49 
 
 
486 aa  364  1e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1504  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  39.2 
 
 
486 aa  362  8e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2963  aminoacyl-histidine dipeptidase  39.5 
 
 
487 aa  345  8e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000053786  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3295  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.17 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3307  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.17 
 
 
486 aa  343  4e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00393893  hitchhiker  0.00000164378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3156  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.97 
 
 
486 aa  342  7e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1744  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.06 
 
 
482 aa  340  5e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129269 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0291  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.59 
 
 
485 aa  339  7e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0453943 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0234  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.59 
 
 
485 aa  339  7e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0282  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.59 
 
 
485 aa  339  7e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.447065 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0264  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.59 
 
 
485 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0269  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.59 
 
 
485 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0763  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.22 
 
 
485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62172  normal  0.0792119 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00232  aminoacyl-histidine dipeptidase (peptidase D)  38.38 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3370  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.59 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00235  hypothetical protein  38.38 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3344  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.38 
 
 
485 aa  337  2.9999999999999997e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0180  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.04 
 
 
487 aa  337  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0963  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.51 
 
 
486 aa  337  3.9999999999999995e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1680  Pep581 peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M20C  39.71 
 
 
484 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0945346  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0954  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.31 
 
 
491 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0173315  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3290  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.34 
 
 
486 aa  333  3e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0950  M20C family Xaa-His dipeptidase  35.99 
 
 
487 aa  332  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.478343  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0355  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.78 
 
 
485 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0357  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.78 
 
 
485 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000446766 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0350  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.78 
 
 
485 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0346  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.78 
 
 
485 aa  332  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0296229  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1115  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.79 
 
 
486 aa  331  2e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0948  M20C family Xaa-His dipeptidase  35.99 
 
 
487 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0986  M20C family Xaa-His dipeptidase  35.99 
 
 
487 aa  331  2e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0895  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.72 
 
 
486 aa  331  2e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0365  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.78 
 
 
485 aa  330  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1869  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.98 
 
 
534 aa  330  4e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.550605  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1387  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.66 
 
 
493 aa  329  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0727929  unclonable  0.0000123065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0962  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.5 
 
 
487 aa  329  7e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0940  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.46 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.282545  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3422  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.46 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1142  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.47 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0672748  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3350  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.46 
 
 
486 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3547  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.05 
 
 
486 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0516  aminoacyl-histidine dipeptidase  39.79 
 
 
492 aa  326  5e-88  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01157  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.68 
 
 
490 aa  326  5e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2852  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.17 
 
 
486 aa  326  6e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.017395  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3421  Xaa-His dipeptidase  35.79 
 
 
486 aa  326  6e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.11643  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2519  Xaa-His dipeptidase  35.38 
 
 
486 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22557  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2364  aminoacyl-histidine dipeptidase  39.25 
 
 
484 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.043104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3603  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.85 
 
 
497 aa  324  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.905731  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004273  aminoacyl-histidine dipeptidase (Peptidase D)  37.06 
 
 
490 aa  323  4e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3039  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.76 
 
 
506 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000107892  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0973  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.11 
 
 
484 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1011  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  34.23 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.855655  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3091  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.61 
 
 
486 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0004  M20C family Xaa-His dipeptidase  34.55 
 
 
486 aa  317  3e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3437  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.93 
 
 
486 aa  317  4e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1584  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.22 
 
 
488 aa  316  5e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0137  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.1 
 
 
484 aa  316  7e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.49846 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1222  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.16 
 
 
486 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.000871052 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2053  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.55 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0928  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.68 
 
 
486 aa  309  5.9999999999999995e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1720  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  33.4 
 
 
484 aa  307  3e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3432  aminoacyl-histidine dipeptidase  33.95 
 
 
487 aa  304  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00107226  hitchhiker  0.000115392 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0525  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  34.51 
 
 
483 aa  303  5.000000000000001e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3389  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.54 
 
 
484 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00176848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1798  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.29 
 
 
484 aa  300  4e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0857  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.92 
 
 
484 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0894  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.39 
 
 
485 aa  298  1e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.011645  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2957  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  35.55 
 
 
487 aa  298  2e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.974491  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12668  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.17 
 
 
487 aa  296  6e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2400  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.34 
 
 
486 aa  296  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2361  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.08 
 
 
490 aa  295  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1877  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.47 
 
 
484 aa  292  7e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.326174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2079  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  36.72 
 
 
484 aa  290  6e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165641  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1035  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.97 
 
 
485 aa  271  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180631  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0622  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.88 
 
 
476 aa  227  5.0000000000000005e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.155688  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0116  aminoacyl-histidine dipeptidase  31.06 
 
 
427 aa  179  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1073  aminoacyl-histidine dipeptidase  30.66 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11078  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0810  aminoacyl-histidine dipeptidase  28.57 
 
 
420 aa  163  7e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000463218  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0809  aminoacyl-histidine dipeptidase  28.21 
 
 
422 aa  162  9e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.697451  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0999  aminoacyl-histidine dipeptidase  27.48 
 
 
422 aa  162  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.738378  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1062  aminoacyl-histidine dipeptidase  27.27 
 
 
422 aa  160  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>