157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1142 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1584  aminoacyl-histidine dipeptidase  67.77 
 
 		 488 aa  684    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1222  aminoacyl-histidine dipeptidase  68.53 
 
 		 486 aa  681    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.121021  hitchhiker  0.000871052 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1680  Pep581 peptidase. metallo peptidase. MEROPS family M20C  70.83 
 
 		 484 aa  706    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0945346  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1142  aminoacyl-histidine dipeptidase  100 
 
 		 500 aa  1007    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0672748  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1387  aminoacyl-histidine dipeptidase  67.69 
 
 		 493 aa  673    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0727929  unclonable  0.0000123065 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0525  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  59.63 
 
 		 483 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.321118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2400  aminoacyl-histidine dipeptidase  52.8 
 
 		 486 aa  514  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0233033  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12668  aminoacyl-histidine dipeptidase  50 
 
 		 487 aa  483  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0537  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.25 
 
 		 486 aa  481  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0137  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.14 
 
 		 484 aa  477  1e-133  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.49846 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0948  M20C family Xaa-His dipeptidase  46.36 
 
 		 487 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0950  M20C family Xaa-His dipeptidase  46.36 
 
 		 487 aa  475  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.478343  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2053  aminoacyl-histidine dipeptidase  50.52 
 
 		 484 aa  478  1e-133  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.754488  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1115  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.57 
 
 		 486 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0986  M20C family Xaa-His dipeptidase  46.15 
 
 		 487 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2519  Xaa-His dipeptidase  46.36 
 
 		 486 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004273  aminoacyl-histidine dipeptidase (Peptidase D)  46.95 
 
 		 490 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01157  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.16 
 
 		 490 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0954  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.11 
 
 		 491 aa  463  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0173315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2364  aminoacyl-histidine dipeptidase  49.06 
 
 		 484 aa  464  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.807685  normal  0.043104 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0180  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.98 
 
 		 487 aa  460  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0940  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.49 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.282545  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3422  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.91 
 
 		 486 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3350  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.91 
 
 		 486 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3547  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.49 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.884299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1011  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  44.7 
 
 		 486 aa  456  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.855655  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0962  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.28 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1869  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.96 
 
 		 534 aa  458  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.550605  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0895  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.3 
 
 		 486 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3603  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.36 
 
 		 497 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.905731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3421  Xaa-His dipeptidase  45.64 
 
 		 486 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.11643  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00232  aminoacyl-histidine dipeptidase (peptidase D)  45.32 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00235  hypothetical protein  45.32 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0264  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.32 
 
 		 485 aa  448  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0269  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.32 
 
 		 485 aa  448  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3091  aminoacyl-histidine dipeptidase  45 
 
 		 486 aa  449  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0282  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.32 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.447065 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3344  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.32 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0291  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.32 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0453943 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0234  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.32 
 
 		 485 aa  450  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3370  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.32 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0928  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.3 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0973  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.06 
 
 		 484 aa  448  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.444707  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0350  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.27 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2852  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.51 
 
 		 486 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.017395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3156  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.05 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0963  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.47 
 
 		 486 aa  446  1.0000000000000001e-124  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3290  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.74 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0357  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.27 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000446766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0355  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.27 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3295  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.26 
 
 		 486 aa  448  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0346  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.27 
 
 		 485 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0296229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0365  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.27 
 
 		 485 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3307  aminoacyl-histidine dipeptidase  44.84 
 
 		 486 aa  443  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00393893  hitchhiker  0.00000164378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0763  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.28 
 
 		 485 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.62172  normal  0.0792119 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3437  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.32 
 
 		 486 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0894  aminoacyl-histidine dipeptidase  42.65 
 
 		 485 aa  413  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.011645  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1744  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.96 
 
 		 482 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.129269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2957  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  45.62 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.974491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1504  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  43.01 
 
 		 486 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.774685 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0857  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.8 
 
 		 484 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2361  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.6 
 
 		 490 aa  409  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0004  M20C family Xaa-His dipeptidase  42.77 
 
 		 486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1035  aminoacyl-histidine dipeptidase  48.42 
 
 		 485 aa  408  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.180631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1720  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  44.54 
 
 		 484 aa  398  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3389  aminoacyl-histidine dipeptidase  45.57 
 
 		 484 aa  398  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00176848  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2403  aminoacyl-histidine dipeptidase  41.25 
 
 		 483 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2115  aminoacyl-histidine dipeptidase  40.83 
 
 		 483 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1798  aminoacyl-histidine dipeptidase  47.11 
 
 		 484 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1877  aminoacyl-histidine dipeptidase  46.68 
 
 		 484 aa  359  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.326174  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2079  peptidase M20C, Xaa-His dipeptidase  46.47 
 
 		 484 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.165641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2587  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.63 
 
 		 489 aa  347  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00120702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2319  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.63 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2498  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.63 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2514  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.63 
 
 		 489 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.411549 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2284  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.63 
 
 		 489 aa  346  6e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00268357  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1800  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.42 
 
 		 489 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2240  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.55 
 
 		 489 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0840688  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2447  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.21 
 
 		 489 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2527  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.21 
 
 		 489 aa  339  9e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.556551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2888  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.21 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.120289  normal  0.458811 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2216  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.37 
 
 		 483 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0150704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3149  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.22 
 
 		 476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.35499  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2512  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.47 
 
 		 483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2301  aminoacyl-histidine dipeptidase  37.89 
 
 		 489 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.280973  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0316  aminoacyl-histidine dipeptidase  38.88 
 
 		 471 aa  326  5e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3039  aminoacyl-histidine dipeptidase  36.92 
 
 		 506 aa  324  2e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000107892  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2963  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.97 
 
 		 487 aa  325  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000053786  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2228  aminoacyl-histidine dipeptidase, putative  35.48 
 
 		 481 aa  323  6e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.371488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2706  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.98 
 
 		 479 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.291599  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2796  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.23 
 
 		 486 aa  292  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000441457  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0516  aminoacyl-histidine dipeptidase  35.52 
 
 		 492 aa  281  2e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0622  aminoacyl-histidine dipeptidase  33.4 
 
 		 476 aa  256  6e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.155688  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3432  aminoacyl-histidine dipeptidase  32.23 
 
 		 487 aa  246  8e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00107226  hitchhiker  0.000115392 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0809  aminoacyl-histidine dipeptidase  32.64 
 
 		 422 aa  201  3.9999999999999996e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.697451  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0116  aminoacyl-histidine dipeptidase  34.84 
 
 		 427 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1343  Xaa-His dipeptidase  33.12 
 
 		 428 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1062  aminoacyl-histidine dipeptidase  31.6 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.211947  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0999  aminoacyl-histidine dipeptidase  31.17 
 
 		 422 aa  191  2e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.738378  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1073  aminoacyl-histidine dipeptidase  31.05 
 
 		 424 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.11078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>