160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0029 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  98.03 
 
 
406 aa  811    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  100 
 
 
406 aa  823    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  63.73 
 
 
414 aa  528  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  62.53 
 
 
411 aa  525  1e-148  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  62.5 
 
 
408 aa  519  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  62.25 
 
 
410 aa  518  1e-146  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  62.03 
 
 
410 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  58.58 
 
 
407 aa  501  1e-140  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  58.31 
 
 
410 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  58.23 
 
 
415 aa  491  1e-137  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  57.32 
 
 
410 aa  482  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3500  peptidase T  57.82 
 
 
412 aa  484  1e-135  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  58.29 
 
 
425 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  57.82 
 
 
410 aa  484  1e-135  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  57.57 
 
 
410 aa  484  1e-135  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3488  peptidase T  56.82 
 
 
410 aa  479  1e-134  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  57.32 
 
 
410 aa  480  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3754  peptidase T  57.07 
 
 
410 aa  480  1e-134  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000202819 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  57.57 
 
 
410 aa  480  1e-134  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  56.82 
 
 
410 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  56.82 
 
 
410 aa  477  1e-133  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  55.77 
 
 
407 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0445  peptidase T  56.79 
 
 
405 aa  469  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0466341 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0772  peptidase T  57.67 
 
 
411 aa  468  9.999999999999999e-131  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.340472  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  56.02 
 
 
413 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  53.47 
 
 
407 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  56.3 
 
 
409 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0925  peptidase T  58.63 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000393366  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  54.3 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  53.75 
 
 
410 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  53.19 
 
 
408 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  53.43 
 
 
408 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  53.43 
 
 
422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  53.43 
 
 
422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  53.19 
 
 
408 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  53.19 
 
 
410 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  53.19 
 
 
408 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  53.43 
 
 
409 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  53.19 
 
 
408 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  53.43 
 
 
422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1942  peptidase T  54.81 
 
 
417 aa  447  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.366024  normal  0.129304 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  53.43 
 
 
408 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  52.71 
 
 
410 aa  443  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  52.96 
 
 
423 aa  444  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  55.47 
 
 
402 aa  443  1e-123  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  53.37 
 
 
409 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  53.68 
 
 
409 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  53.68 
 
 
409 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  51.72 
 
 
423 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  53.68 
 
 
409 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  53.68 
 
 
409 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  53.43 
 
 
409 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  51.25 
 
 
409 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  52.87 
 
 
408 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  52.87 
 
 
408 aa  432  1e-120  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  52.45 
 
 
411 aa  433  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  52.45 
 
 
411 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  52.45 
 
 
411 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  50.74 
 
 
409 aa  429  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  54 
 
 
410 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0410  peptidase T  51.87 
 
 
412 aa  418  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.88832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  52.24 
 
 
406 aa  418  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1996  peptidase T  51.47 
 
 
413 aa  421  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1094  peptidase T  53.63 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.357945  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  50.99 
 
 
416 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  54.93 
 
 
406 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0998  peptidase T  48.01 
 
 
407 aa  392  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  46.8 
 
 
430 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  46.93 
 
 
418 aa  385  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  45.93 
 
 
414 aa  382  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  46.8 
 
 
417 aa  383  1e-105  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  47.78 
 
 
427 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  46.42 
 
 
410 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  46.55 
 
 
420 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  47.16 
 
 
410 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  46.83 
 
 
412 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  45.81 
 
 
417 aa  369  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  45.16 
 
 
411 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1109  peptidase T  46.29 
 
 
415 aa  368  1e-100  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  45.34 
 
 
417 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  43.73 
 
 
420 aa  361  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  45.21 
 
 
417 aa  358  8e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  43.5 
 
 
425 aa  350  2e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  44.17 
 
 
408 aa  350  3e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  44.06 
 
 
418 aa  345  1e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  40.79 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  43.2 
 
 
420 aa  328  8e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  41.13 
 
 
414 aa  319  7e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  41.52 
 
 
409 aa  317  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  43.07 
 
 
414 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  40.1 
 
 
415 aa  311  2e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  40.55 
 
 
422 aa  307  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  39.56 
 
 
411 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2931  peptidase T  40.15 
 
 
409 aa  300  2e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  40.84 
 
 
407 aa  300  2e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0953  peptidase T  38.35 
 
 
416 aa  299  7e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2412  peptidase T  38.79 
 
 
416 aa  295  1e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2506  peptidase T  37.01 
 
 
413 aa  289  6e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1193  peptidase T  41.54 
 
 
409 aa  288  1e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3359  peptidase T  38.08 
 
 
410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>