159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2396 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  75.78 
 
 		 417 aa  678    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  81.93 
 
 		 420 aa  712    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  100 
 
 		 427 aa  871    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  81.73 
 
 		 430 aa  723    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  74.58 
 
 		 417 aa  665    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  77.83 
 
 		 418 aa  684    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  80.43 
 
 		 417 aa  689    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  70.34 
 
 		 410 aa  610  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  70.1 
 
 		 410 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  66.99 
 
 		 420 aa  582  1.0000000000000001e-165  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  63.68 
 
 		 417 aa  569  1e-161  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  66.67 
 
 		 411 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  63.48 
 
 		 412 aa  554  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  64.32 
 
 		 414 aa  545  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  50.12 
 
 		 411 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0445  peptidase T  50 
 
 		 405 aa  408  1e-113  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0466341 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  48.17 
 
 		 410 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  47.54 
 
 		 414 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  48.65 
 
 		 407 aa  396  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  48.89 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  48.02 
 
 		 425 aa  386  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  47.32 
 
 		 422 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  48 
 
 		 409 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  47.78 
 
 		 406 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  47.29 
 
 		 415 aa  384  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  47.17 
 
 		 410 aa  382  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  47.17 
 
 		 413 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  49.88 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  46.68 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  47.29 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  47.15 
 
 		 408 aa  378  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  46.93 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3488  peptidase T  45.95 
 
 		 410 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3500  peptidase T  45.76 
 
 		 412 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  46.68 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  45.91 
 
 		 407 aa  374  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  46.93 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3754  peptidase T  46.19 
 
 		 410 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000202819 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  45.95 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  45.95 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  47.41 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  46.68 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  46.93 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0925  peptidase T  47.62 
 
 		 401 aa  365  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000393366  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  47.1 
 
 		 410 aa  353  4e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1942  peptidase T  46.56 
 
 		 417 aa  348  1e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.366024  normal  0.129304 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  44.09 
 
 		 407 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  45.61 
 
 		 408 aa  342  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  45.61 
 
 		 408 aa  342  5e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  44.17 
 
 		 410 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  42.72 
 
 		 408 aa  340  2.9999999999999998e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0772  peptidase T  44.23 
 
 		 411 aa  338  8e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.340472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  44.61 
 
 		 408 aa  335  9e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  43.26 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  43.26 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  44.36 
 
 		 408 aa  332  6e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  44.36 
 
 		 409 aa  332  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  43.84 
 
 		 409 aa  332  1e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  44.12 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  44.12 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  44.12 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  44.12 
 
 		 408 aa  330  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  44.42 
 
 		 422 aa  330  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  44.85 
 
 		 409 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  44.85 
 
 		 409 aa  328  9e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  44.36 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  44.85 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  44.85 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  44.61 
 
 		 409 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  43.64 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1996  peptidase T  41.58 
 
 		 413 aa  326  5e-88  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  42.65 
 
 		 411 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  42.65 
 
 		 411 aa  324  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  43.61 
 
 		 406 aa  324  2e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  42.65 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  42.89 
 
 		 423 aa  323  3e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  42.33 
 
 		 409 aa  323  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  43.39 
 
 		 410 aa  322  9.000000000000001e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0410  peptidase T  43.5 
 
 		 412 aa  322  9.999999999999999e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.88832  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  40.5 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  41.48 
 
 		 416 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1109  peptidase T  40.15 
 
 		 415 aa  316  6e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  40.93 
 
 		 409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1094  peptidase T  43.86 
 
 		 407 aa  311  1e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.357945  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  39.76 
 
 		 420 aa  297  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  40.59 
 
 		 406 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  38.92 
 
 		 414 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0998  peptidase T  38.12 
 
 		 407 aa  286  5.999999999999999e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109897  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  38.56 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  33.58 
 
 		 425 aa  254  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  36.39 
 
 		 409 aa  252  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  36.27 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3359  peptidase T  38.08 
 
 		 410 aa  249  6e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0166  peptidase T  36.27 
 
 		 414 aa  248  2e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2931  peptidase T  36.27 
 
 		 409 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  35.02 
 
 		 414 aa  244  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5042  peptidase T  38.52 
 
 		 414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.918686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0680  peptidase T  36.52 
 
 		 410 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5411  peptidase T  38.79 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.683579  normal  0.180292 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0749  peptidase T  36.52 
 
 		 410 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>