17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2861 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2861  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  789    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.175603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1901  peptidase M20  31.27 
 
 
403 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.296335  normal  0.958689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2393  peptidase dimerisation domain protein  27.32 
 
 
402 aa  117  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000137501  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0276  peptidase M20  27.02 
 
 
361 aa  113  7.000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3696  peptidase M20  28.12 
 
 
452 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1442  peptidase M20  30.88 
 
 
417 aa  105  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2667  peptidase M20  28.13 
 
 
461 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00943283  normal  0.323066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5278  peptidase M20  29.73 
 
 
454 aa  95.9  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3913  peptidase M20  23.49 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.806935  normal  0.526735 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0805  peptidase M20  22.71 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2509  peptidase M20  23.57 
 
 
337 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3346  peptidase M20  20.06 
 
 
453 aa  59.7  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0581129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1895  peptidase T-like protein  21.92 
 
 
368 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0027  peptidase T-like protein  23.03 
 
 
372 aa  46.6  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3813  peptidase T-like protein  23.98 
 
 
360 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.119165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  25.59 
 
 
377 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  24.49 
 
 
382 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>