154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4006 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4006  peptidase T  100 
 
 		 409 aa  844    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000311965 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2943  peptidase T  74.45 
 
 		 407 aa  654    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4149  peptidase T  81.03 
 
 		 410 aa  709    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652019  normal  0.399065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3250  peptidase T  70.17 
 
 		 409 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124767  normal  0.62095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2574  peptidase T  55.31 
 
 		 411 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05384  peptidase T  58.02 
 
 		 413 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2520  peptidase T  55.67 
 
 		 408 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00630559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1640  peptidase T  54.07 
 
 		 422 aa  468  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1290  peptidase T  55.67 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1568  peptidase T  55.67 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000893895 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000506  tripeptide aminopeptidase  57.88 
 
 		 412 aa  470  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1998  peptidase T  55.67 
 
 		 422 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1305  peptidase T  55.67 
 
 		 408 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1328  peptidase T  56.51 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.245439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1344  peptidase T  56.51 
 
 		 409 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.595235 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1306  peptidase T  56.76 
 
 		 409 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.841149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1957  peptidase T  56.76 
 
 		 409 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.355866  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2139  peptidase T  56.51 
 
 		 409 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.359418  normal  0.0575573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01125  peptidase T  55.42 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.671932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01133  hypothetical protein  55.42 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.684564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1247  peptidase T  55.42 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2476  peptidase T  55.42 
 
 		 408 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1605  peptidase T  55.28 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.888107  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1595  peptidase T  53.88 
 
 		 410 aa  461  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.782792  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2858  peptidase T  55.28 
 
 		 411 aa  464  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1712  peptidase T  55.28 
 
 		 411 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08441  peptidase T  54.05 
 
 		 415 aa  461  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2205  peptidase T  53.38 
 
 		 425 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1936  peptidase T  55.04 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1863  peptidase T  54.59 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.264839  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0029  peptidase T  53.37 
 
 		 406 aa  453  1.0000000000000001e-126  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2069  peptidase T  53.41 
 
 		 423 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2148  peptidase T  54.09 
 
 		 410 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.32908  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0029  peptidase T  52.87 
 
 		 406 aa  450  1e-125  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2411  peptidase T  53.43 
 
 		 410 aa  450  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.825579  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3224  peptidase T  54.05 
 
 		 410 aa  449  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.525906  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0399  peptidase T  53.69 
 
 		 409 aa  450  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.168902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2009  peptidase T  52.09 
 
 		 409 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0459341 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3512  peptidase T  52.08 
 
 		 410 aa  444  1e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3775  peptidase T  52.32 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.524729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3488  peptidase T  52.08 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.25106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1456  peptidase T  51.83 
 
 		 410 aa  438  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000103305 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3843  peptidase T  52.08 
 
 		 410 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3791  peptidase T  52.57 
 
 		 410 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1622  peptidase T  51.35 
 
 		 407 aa  439  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3588  peptidase T  51.83 
 
 		 410 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3500  peptidase T  52.32 
 
 		 412 aa  437  1e-121  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3872  peptidase T  51.83 
 
 		 410 aa  435  1e-121  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3754  peptidase T  52.08 
 
 		 410 aa  437  1e-121  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000202819 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1206  peptidase T  52.59 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.44823  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0445  peptidase T  52.09 
 
 		 405 aa  429  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0466341 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09630  peptidase T  51.86 
 
 		 408 aa  430  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1096  peptidase T  53.73 
 
 		 410 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1942  peptidase T  49.01 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.366024  normal  0.129304 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0772  peptidase T  51.23 
 
 		 411 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.340472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0767  peptidase T  51.6 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0758146  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0784  peptidase T  51.6 
 
 		 408 aa  415  9.999999999999999e-116  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0685996  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1057  peptidase T  50.12 
 
 		 402 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0410  peptidase T  48.66 
 
 		 412 aa  398  9.999999999999999e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.88832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3349  peptidase T  46.53 
 
 		 407 aa  388  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0105753  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0925  peptidase T  48.13 
 
 		 401 aa  386  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000393366  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0748  peptidase T  46.72 
 
 		 416 aa  382  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1389  peptidase T  47.76 
 
 		 406 aa  377  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0424518  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1996  peptidase T  47.55 
 
 		 413 aa  375  1e-103  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1109  peptidase T  46.21 
 
 		 415 aa  369  1e-101  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1094  peptidase T  50.12 
 
 		 407 aa  368  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.357945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1652  peptidase T  43.72 
 
 		 425 aa  344  1e-93  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0264694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2569  peptidase T  43.49 
 
 		 420 aa  342  7e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2396  peptidase T  43.73 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0937974 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1893  peptidase T  42.61 
 
 		 417 aa  339  5e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.884086 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0998  peptidase T  42.43 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.109897  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4565  peptidase T  42.54 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.36314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1922  peptidase T  42.54 
 
 		 411 aa  336  5e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0945  peptidase T  45.45 
 
 		 406 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2224  peptidase T  42.68 
 
 		 417 aa  334  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.34281  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3303  peptidase T  43 
 
 		 417 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2890  peptidase T  41.63 
 
 		 430 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.223061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6480  peptidase T  42.65 
 
 		 414 aa  333  4e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.800823  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5848  peptidase T  42.3 
 
 		 410 aa  333  4e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.362354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2425  peptidase T  40.79 
 
 		 420 aa  332  7.000000000000001e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.91324  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6760  peptidase T  41.81 
 
 		 410 aa  331  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3404  peptidase T  41.08 
 
 		 427 aa  330  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5117  peptidase T  40.59 
 
 		 412 aa  323  3e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0529  peptidase T  41.34 
 
 		 408 aa  319  7e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00086333  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0101  peptidase T  40.59 
 
 		 417 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0461274  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3800  peptidase T  41.03 
 
 		 422 aa  309  5.9999999999999995e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0648  peptidase T  40.69 
 
 		 415 aa  305  9.000000000000001e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.60889 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0953  peptidase T  40.44 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1115  peptidase T  39.95 
 
 		 418 aa  288  9e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0155  peptidase T  37.59 
 
 		 420 aa  285  9e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2074  peptidase T  38.5 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5042  peptidase T  38.39 
 
 		 414 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.918686 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5411  peptidase T  38.63 
 
 		 414 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.683579  normal  0.180292 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1530  peptidase T  37.53 
 
 		 411 aa  273  5.000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2931  peptidase T  37.5 
 
 		 409 aa  269  7e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3612  peptidase T  38.08 
 
 		 407 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.0032561  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3359  peptidase T  37.25 
 
 		 410 aa  263  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1069  peptidase T  36.92 
 
 		 414 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0800  peptidase T  37.19 
 
 		 407 aa  260  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4406  peptidase T  37.35 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.554315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>