More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2091 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 		 415 aa  830    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5111  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  56.47 
 
 		 447 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  44.69 
 
 		 409 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  44.17 
 
 		 409 aa  329  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  44.2 
 
 		 409 aa  327  3e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  43.11 
 
 		 428 aa  325  8.000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  42.36 
 
 		 425 aa  308  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  41.21 
 
 		 429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  44.17 
 
 		 425 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0047  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.01 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.21885  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  42.72 
 
 		 412 aa  297  2e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3439  allantoate amidohydrolase  41.79 
 
 		 427 aa  295  7e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0973396  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6654  allantoate amidohydrolase  40.88 
 
 		 426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0127692 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2180  allantoate amidohydrolase  43.17 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2039  allantoate amidohydrolase  43.17 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6087  amidase  40.93 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.976805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  41.38 
 
 		 418 aa  285  9e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1948  allantoate amidohydrolase  42.23 
 
 		 421 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.361736  normal  0.810576 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  43.31 
 
 		 415 aa  285  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1597  allantoate amidohydrolase  40.63 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5723  amidase, hydantoinase/carbamoylase  41.12 
 
 		 523 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6234  allantoate amidohydrolase  40.63 
 
 		 426 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.535811  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6710  allantoate amidohydrolase  40.63 
 
 		 426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.150854  normal  0.55827 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  42.37 
 
 		 437 aa  284  3.0000000000000004e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  43 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4755  amidase  40.99 
 
 		 419 aa  283  4.0000000000000003e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6570  amidase  41.75 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5349  allantoate amidohydrolase  40.84 
 
 		 426 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223299 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4480  N-carbamoyl-L-amino-acid hydrolase  42.26 
 
 		 420 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0132912  normal  0.010992 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5967  allantoate amidohydrolase  41.12 
 
 		 426 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.619712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2865  amidase  41.95 
 
 		 421 aa  282  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.129348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4903  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.05 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.810439  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1586  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.25 
 
 		 418 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.484482  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3826  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.05 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0970  amidase  40.89 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3991  allantoate amidohydrolase  41.2 
 
 		 418 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5723  allantoate amidohydrolase  40.88 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0158  allantoate amidohydrolase  41.49 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.1 
 
 		 426 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.52 
 
 		 421 aa  279  8e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1838  allantoate amidohydrolase  41.46 
 
 		 427 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal  0.060174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1498  allantoate amidohydrolase  42.05 
 
 		 414 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3508  allantoate amidohydrolase  40.62 
 
 		 418 aa  278  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  40.99 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3426  allantoate amidohydrolase  41.26 
 
 		 418 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  41.26 
 
 		 415 aa  277  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1427  allantoate amidohydrolase  40.84 
 
 		 426 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.841231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.53 
 
 		 412 aa  276  3e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4148  amidase  39.85 
 
 		 421 aa  277  3e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05810  allantoate amidohydrolase  41.22 
 
 		 427 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4068  allantoate amidohydrolase  41.16 
 
 		 414 aa  276  4e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1804  allantoate amidohydrolase  40.68 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.58036  normal  0.76978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3636  allantoate amidohydrolase  40.44 
 
 		 427 aa  276  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2691  allantoate amidohydrolase  40.15 
 
 		 426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4269  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4097  allantoate amidohydrolase  40.98 
 
 		 418 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850952  normal  0.717406 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38.24 
 
 		 412 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1536  allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 		 425 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2561  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.6 
 
 		 426 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4034  allantoate amidohydrolase  40.44 
 
 		 427 aa  273  3e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  40.54 
 
 		 422 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  43.13 
 
 		 415 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  40.62 
 
 		 422 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.25 
 
 		 413 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0547  allantoate amidohydrolase  40.49 
 
 		 427 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  40.24 
 
 		 426 aa  270  5e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  39.36 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1342  allantoate amidohydrolase  41.44 
 
 		 417 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  38.52 
 
 		 425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1622  allantoate amidohydrolase  40.78 
 
 		 418 aa  266  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38 
 
 		 424 aa  265  8e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0654  allantoate amidohydrolase  40.39 
 
 		 425 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.385596  normal  0.174957 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  40.2 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0614  allantoate amidohydrolase  40.15 
 
 		 425 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  40.2 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  41.91 
 
 		 418 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  40.15 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0031  amidase, hydantoinase/carbamoylase  39.01 
 
 		 416 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  39.86 
 
 		 415 aa  263  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  42.05 
 
 		 422 aa  262  8.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1293  amidase  37.14 
 
 		 411 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.569361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  41.69 
 
 		 422 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  38.27 
 
 		 423 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1455  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.89 
 
 		 430 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2063  allantoate amidohydrolase  39.11 
 
 		 423 aa  259  6e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  36.14 
 
 		 411 aa  258  2e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1367  allantoate amidohydrolase  38.05 
 
 		 424 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.388728 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2555  amidase  41.12 
 
 		 408 aa  258  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  37.01 
 
 		 407 aa  258  2e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  38.27 
 
 		 423 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  35.75 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1498  allantoate amidohydrolase  37.41 
 
 		 416 aa  256  4e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  37.87 
 
 		 423 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  37.87 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  37.87 
 
 		 425 aa  256  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  37.71 
 
 		 479 aa  256  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4267  amidase  40.53 
 
 		 424 aa  256  7e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  38.69 
 
 		 413 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4490  allantoate amidohydrolase  39.81 
 
 		 423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.702219 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4391  allantoate amidohydrolase  38.33 
 
 		 427 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>