32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2092 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  100 
 
 		 621 aa  1169    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  60.91 
 
 		 702 aa  578  1e-164  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  51.77 
 
 		 706 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  56 
 
 		 1434 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  46.45 
 
 		 11716 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  49.12 
 
 		 640 aa  351  2e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  46.53 
 
 		 1827 aa  226  8e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  33.02 
 
 		 2064 aa  219  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  32.18 
 
 		 811 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  34.57 
 
 		 819 aa  208  2e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.4 
 
 		 2507 aa  192  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  33.33 
 
 		 1437 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  32.64 
 
 		 1348 aa  151  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  32.15 
 
 		 1337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  30.32 
 
 		 1433 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  30.27 
 
 		 1346 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  34.3 
 
 		 937 aa  135  3e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  29.1 
 
 		 503 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  34.83 
 
 		 885 aa  110  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  31.5 
 
 		 1073 aa  110  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  32.57 
 
 		 935 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  29.46 
 
 		 749 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  29.51 
 
 		 752 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  33.2 
 
 		 466 aa  67.8  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  32.65 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  30.24 
 
 		 485 aa  56.2  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  27 
 
 		 500 aa  55.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  26.33 
 
 		 3204 aa  51.6  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  26.26 
 
 		 2911 aa  50.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3577  FG-GAP repeat protein  26.35 
 
 		 1022 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00287898 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.51 
 
 		 959 aa  46.2  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.69 
 
 		 621 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>