37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3991 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 500 aa  968    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  29.53 
 
 		 466 aa  119  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  30.6 
 
 		 1437 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  43.92 
 
 		 458 aa  93.2  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  28.44 
 
 		 1346 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  29.25 
 
 		 1348 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.13 
 
 		 2507 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  29.19 
 
 		 1337 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  31.37 
 
 		 485 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  28.7 
 
 		 1433 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0908  hypothetical protein  32.6 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  24.94 
 
 		 749 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0906  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.82 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.40669 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  28.37 
 
 		 1434 aa  64.7  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3560  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.68 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  27.73 
 
 		 702 aa  60.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0907  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.12 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26698 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  29.66 
 
 		 640 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  27 
 
 		 752 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  28.44 
 
 		 447 aa  58.2  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  38.89 
 
 		 885 aa  57.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  27 
 
 		 621 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  28.91 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  26.74 
 
 		 828 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  30.37 
 
 		 1827 aa  53.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  25 
 
 		 1490 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  32 
 
 		 720 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.26 
 
 		 11716 aa  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  36.43 
 
 		 937 aa  48.9  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  27.57 
 
 		 1275 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  36.45 
 
 		 2911 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  36.45 
 
 		 3204 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  25.73 
 
 		 1019 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.36 
 
 		 1114 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  39.77 
 
 		 706 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  29.21 
 
 		 404 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.77 
 
 		 1118 aa  44.3  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>