10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3560 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3560  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  100 
 
 		 472 aa  947    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0907  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  53.31 
 
 		 502 aa  491  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0906  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  50.96 
 
 		 493 aa  479  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.40669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0908  hypothetical protein  42.31 
 
 		 482 aa  327  3e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  29.77 
 
 		 485 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  30.92 
 
 		 466 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  27.82 
 
 		 458 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  28.15 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  25.06 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.67 
 
 		 680 aa  52.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>