45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0477 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 466 aa  902    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  29.34 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  30.57 
 
 		 1434 aa  97.8  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  30.39 
 
 		 1437 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  30.19 
 
 		 1348 aa  79.7  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  29.27 
 
 		 1337 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  30.79 
 
 		 1346 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  30.28 
 
 		 485 aa  72.4  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  29.31 
 
 		 1433 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  33.2 
 
 		 621 aa  67.8  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  28.74 
 
 		 749 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3560  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.92 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0906  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.31 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.40669 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  30.96 
 
 		 640 aa  60.5  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0907  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.41 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26698 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35 
 
 		 1113 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.78 
 
 		 1118 aa  58.2  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.4 
 
 		 1225 aa  58.5  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.82 
 
 		 1012 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  26.22 
 
 		 702 aa  57.4  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.62 
 
 		 1222 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  32 
 
 		 458 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  29.48 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  27.55 
 
 		 752 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.02 
 
 		 11716 aa  55.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  29.58 
 
 		 554 aa  54.7  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  31.91 
 
 		 2507 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 2194 aa  54.3  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  27.36 
 
 		 1019 aa  53.9  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  30.43 
 
 		 1827 aa  53.5  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.19 
 
 		 1340 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  33.93 
 
 		 937 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  29.86 
 
 		 889 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  29.8 
 
 		 458 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  26.35 
 
 		 1009 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0908  hypothetical protein  26.89 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  33.79 
 
 		 872 aa  47.8  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  27.69 
 
 		 885 aa  46.6  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  28.5 
 
 		 657 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  28.57 
 
 		 1126 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  23.71 
 
 		 4379 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  31.28 
 
 		 706 aa  45.8  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.89 
 
 		 1236 aa  44.7  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.18 
 
 		 1228 aa  43.9  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  27.41 
 
 		 539 aa  43.5  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>