38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1762 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  100 
 
 
640 aa  1209    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  59.8 
 
 
1434 aa  484  1e-135  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  59.8 
 
 
702 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  56.07 
 
 
11716 aa  456  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  49.12 
 
 
621 aa  391  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  41.43 
 
 
706 aa  311  2e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  46.04 
 
 
1827 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  32.28 
 
 
2064 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  36.48 
 
 
2507 aa  220  7e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  34.91 
 
 
811 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  35.33 
 
 
819 aa  211  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  33.26 
 
 
1437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  38 
 
 
937 aa  164  6e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  37.74 
 
 
503 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  30.63 
 
 
1346 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  31.93 
 
 
1348 aa  157  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  34.36 
 
 
1337 aa  156  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  34.27 
 
 
1433 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.42 
 
 
1073 aa  146  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  34.66 
 
 
885 aa  122  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  29.98 
 
 
749 aa  120  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  34.35 
 
 
935 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  28.79 
 
 
752 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  29.2 
 
 
466 aa  60.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  29.16 
 
 
500 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  36.84 
 
 
706 aa  58.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.99 
 
 
635 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2201  cable pili-associated 22 kDa adhesin protein  26.91 
 
 
2911 aa  52.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.266239  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  33.51 
 
 
3204 aa  52  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  25.33 
 
 
466 aa  50.4  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  39.81 
 
 
485 aa  50.4  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  27.24 
 
 
917 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  31.06 
 
 
458 aa  47.4  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6179  peptidase M12A astacin  25.06 
 
 
615 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0299292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.12 
 
 
621 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2271  Hemolysin-type calcium-binding region  60 
 
 
272 aa  44.7  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.820331  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.84 
 
 
1154 aa  43.9  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  25.23 
 
 
539 aa  43.9  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>