10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0907 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0907  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  100 
 
 		 502 aa  1013    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.26698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0906  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  53.47 
 
 		 493 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.40669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3560  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  53.31 
 
 		 472 aa  458  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0908  hypothetical protein  44.12 
 
 		 482 aa  348  1e-94  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.346028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3228  hypothetical protein  32.72 
 
 		 485 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6921 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  33.85 
 
 		 458 aa  66.6  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  33.12 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  29.41 
 
 		 466 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  28.38 
 
 		 458 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  33.57 
 
 		 937 aa  45.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>