30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2094 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  100 
 
 		 706 aa  1362    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  52.08 
 
 		 621 aa  479  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2093  Integrins alpha chain  54.15 
 
 		 702 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.120289  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1337  Integrins alpha chain  44.16 
 
 		 1434 aa  397  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153084  normal  0.903463 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.05 
 
 		 11716 aa  362  2e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1762  Integrins alpha chain  41.68 
 
 		 640 aa  302  1e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000197793  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3694  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.05 
 
 		 2507 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2273  FG-GAP repeat protein  39.41 
 
 		 1827 aa  182  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1985  FG-GAP repeat-containing protein  31.63 
 
 		 2064 aa  180  7e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518601  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0768  hypothetical protein  30.55 
 
 		 819 aa  169  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.784858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0767  hypothetical protein  30.42 
 
 		 811 aa  167  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.4016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  31.82 
 
 		 1437 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3145  FG-GAP repeat protein  32.11 
 
 		 1346 aa  140  6e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  30.5 
 
 		 1348 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  30.72 
 
 		 1433 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3146  FG-GAP repeat protein  29.64 
 
 		 1337 aa  132  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5731  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.49 
 
 		 1073 aa  121  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4585  FG-GAP repeat-containing protein  30.74 
 
 		 503 aa  113  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000887674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  32.7 
 
 		 937 aa  112  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3327  Ig family protein  33.85 
 
 		 935 aa  109  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4195  FG-GAP repeat protein  27.14 
 
 		 749 aa  108  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.003825  normal  0.0840228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4196  FG-GAP repeat protein  28.19 
 
 		 752 aa  99.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000719971  normal  0.263746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1222  FG-GAP repeat protein  31.83 
 
 		 885 aa  99  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0477  FG-GAP repeat protein  27.19 
 
 		 466 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503985 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2935  FG-GAP repeat protein  27.08 
 
 		 749 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2063  type I secretion target repeat-containing protein  28.64 
 
 		 3204 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3161  FG-GAP repeat protein  29.17 
 
 		 753 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000585686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3991  FG-GAP repeat protein  25.25 
 
 		 500 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1909  FG-GAP repeat-containing protein  37.86 
 
 		 458 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.121674 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0544  hypothetical protein  24.83 
 
 		 680 aa  46.2  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>