12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2935 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2935  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 749 aa  1420    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3161  FG-GAP repeat protein  92.21 
 
 		 753 aa  1248    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000585686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  36.01 
 
 		 1638 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6179  peptidase M12A astacin  32.2 
 
 		 615 aa  144  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0299292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.06 
 
 		 621 aa  52  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0159  insecticidal toxin complex protein TcdB2  27.75 
 
 		 2417 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.163635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0177  insecticidal toxin complex protein TcdB2  27.75 
 
 		 2458 aa  50.8  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2094  Integrins alpha chain  26.77 
 
 		 706 aa  50.8  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0736075  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  26.58 
 
 		 494 aa  48.5  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  26.68 
 
 		 1490 aa  47.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  27.82 
 
 		 1348 aa  45.8  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2092  Integrins alpha chain  28.34 
 
 		 621 aa  44.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0373824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>