35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1083 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1190  glycoside hydrolase family protein  97.52 
 
 		 807 aa  1559    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.112997  normal  0.725074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4999  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase  71.8 
 
 		 834 aa  1176    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.517089  normal  0.335211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1083  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 807 aa  1622    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0815  glycosy hydrolase family protein  35.36 
 
 		 1127 aa  507  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0285  endo-beta-N-acetylglucosaminidase  39.26 
 
 		 1135 aa  484  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0280  glycosy hydrolase family protein  38.72 
 
 		 740 aa  476  1e-133  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  36.21 
 
 		 951 aa  405  1e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0197  endo-beta-N-acetylglucosaminidase D  36.64 
 
 		 927 aa  399  9.999999999999999e-111  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  32.07 
 
 		 880 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0126  glycoside hydrolase family protein  30.62 
 
 		 586 aa  228  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0534718  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0300  glycoside hydrolase family protein  30.4 
 
 		 592 aa  202  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4670  alpha-1,2-mannosidase  46.9 
 
 		 899 aa  124  6e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00187508  normal  0.0229721 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1713  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.83 
 
 		 454 aa  108  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  40 
 
 		 1164 aa  89.7  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  34 
 
 		 752 aa  60.8  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0487  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.29 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  36 
 
 		 999 aa  56.2  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0755  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  36.05 
 
 		 344 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35 
 
 		 578 aa  53.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  33.33 
 
 		 637 aa  52  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.49 
 
 		 1212 aa  50.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.77 
 
 		 915 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 		 581 aa  48.1  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.83 
 
 		 1007 aa  47.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1200 aa  47.8  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2035  peptidase S45 penicillin amidase  35.83 
 
 		 1070 aa  46.6  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.973933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.08 
 
 		 755 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.79 
 
 		 819 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  33.79 
 
 		 433 aa  46.6  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  34.78 
 
 		 933 aa  45.8  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5094  conserved repeat domain protein  37.29 
 
 		 4013 aa  45.4  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  38.55 
 
 		 953 aa  45.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3492  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.77 
 
 		 962 aa  45.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.536777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2003  hypothetical protein  30.61 
 
 		 850 aa  44.7  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614926  normal  0.156337 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 		 578 aa  44.3  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>