32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4658 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7012  hypothetical protein  77.49 
 
 		 675 aa  949    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.342221  hitchhiker  0.00752546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4658  mycodextranase  100 
 
 		 671 aa  1353    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.575597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1605  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.28 
 
 		 1212 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.232079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3706  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.8 
 
 		 823 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301567  normal  0.394151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3294  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.09 
 
 		 1109 aa  279  1e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1882  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.97 
 
 		 1410 aa  263  8e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3707  Carbohydrate binding family 6  31.5 
 
 		 1000 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.176968  normal  0.212982 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1873  carbohydrate-binding family 6 protein  30.39 
 
 		 1091 aa  231  2e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00027012  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1017  parallel beta-helix repeat-containing protein  30 
 
 		 584 aa  220  7e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3140  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1213 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242437  normal  0.09538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  31.77 
 
 		 1200 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  30.15 
 
 		 1448 aa  177  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1308  APHP domain-containing protein  28.44 
 
 		 1085 aa  173  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0025589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  29.02 
 
 		 1418 aa  160  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4337  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.14 
 
 		 933 aa  118  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.202539 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  27.02 
 
 		 981 aa  95.1  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0792  hypothetical protein  28.57 
 
 		 431 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.992362  normal  0.972599 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2293  parallel beta-helix repeat-containing protein  29.71 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2429  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.87 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1457  putative lipoprotein  25.21 
 
 		 419 aa  56.6  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1813  hypothetical protein  25.76 
 
 		 429 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.679097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0434  putative lipoprotein  24.79 
 
 		 421 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1320  putative lipoprotein  24.38 
 
 		 420 aa  55.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0716  putative lipoprotein  24.79 
 
 		 421 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1151  putative lipoprotein  24.79 
 
 		 421 aa  55.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.403494  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1808  putative lipoprotein  24.79 
 
 		 420 aa  55.1  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00934071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1311  putative lipoprotein  25.1 
 
 		 420 aa  54.3  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3715  parallel beta-helix repeat-containing protein  28.99 
 
 		 563 aa  53.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.145721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4103  hypothetical protein  26.57 
 
 		 424 aa  51.2  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3628  hypothetical protein  26.57 
 
 		 424 aa  50.8  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.174026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4400  hypothetical protein  26.52 
 
 		 423 aa  49.3  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0913462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7522  hypothetical protein  25.27 
 
 		 807 aa  45.8  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.856232  normal  0.934418 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>