47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2195 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  100 
 
 		 676 aa  1321    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  63.25 
 
 		 575 aa  654    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  53.24 
 
 		 684 aa  634  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  44.99 
 
 		 659 aa  505  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  50.58 
 
 		 529 aa  415  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  50.61 
 
 		 680 aa  395  1e-108  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  46.77 
 
 		 548 aa  391  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  45.87 
 
 		 682 aa  355  2e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  42.86 
 
 		 680 aa  335  2e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.63 
 
 		 680 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.41 
 
 		 693 aa  308  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41.13 
 
 		 590 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.92 
 
 		 587 aa  280  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  44.12 
 
 		 674 aa  278  2e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 691 aa  269  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  38.52 
 
 		 609 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  37.09 
 
 		 666 aa  234  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  39.25 
 
 		 406 aa  231  3e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.25 
 
 		 1537 aa  227  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  34.76 
 
 		 706 aa  224  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.78 
 
 		 627 aa  205  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  32.03 
 
 		 824 aa  172  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.58 
 
 		 830 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2251  hypothetical protein  61.07 
 
 		 887 aa  164  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00410803  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  33.74 
 
 		 466 aa  161  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.98 
 
 		 404 aa  145  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.36 
 
 		 486 aa  124  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  60.4 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  45 
 
 		 232 aa  110  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  30.82 
 
 		 444 aa  98.2  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  28.64 
 
 		 449 aa  93.6  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0646  hypothetical protein  32.78 
 
 		 521 aa  92.4  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  25.52 
 
 		 651 aa  82.8  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1205  hypothetical protein  31.43 
 
 		 537 aa  81.6  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000167007  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  31.16 
 
 		 872 aa  77.4  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  31.58 
 
 		 554 aa  74.3  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  29.55 
 
 		 431 aa  70.1  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  25.63 
 
 		 1672 aa  69.3  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  27.56 
 
 		 458 aa  67.8  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  26.16 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  25.85 
 
 		 410 aa  65.1  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  26.9 
 
 		 1437 aa  63.2  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  25.33 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.93 
 
 		 595 aa  57.8  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  26.24 
 
 		 692 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3148  FG-GAP repeat protein  28.57 
 
 		 1348 aa  52  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.589686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0138  FG-GAP repeat protein  30.58 
 
 		 937 aa  45.1  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.247842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>