30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_5056 on replicon NC_009973
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  288  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  82.95 
 
 		 548 aa  145  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  69.32 
 
 		 659 aa  123  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  68.18 
 
 		 682 aa  121  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  64.44 
 
 		 680 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  60.23 
 
 		 680 aa  110  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  62.5 
 
 		 676 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  62.92 
 
 		 529 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  58.89 
 
 		 674 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  51 
 
 		 680 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  76.12 
 
 		 406 aa  102  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  56.67 
 
 		 693 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  55.91 
 
 		 684 aa  102  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  50 
 
 		 590 aa  99  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  41.26 
 
 		 575 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  58.14 
 
 		 232 aa  97.4  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  54.35 
 
 		 587 aa  95.1  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  52.63 
 
 		 1537 aa  94.4  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.83 
 
 		 691 aa  91.7  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  50 
 
 		 609 aa  81.6  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  50.57 
 
 		 627 aa  71.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  45.56 
 
 		 706 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  39.5 
 
 		 666 aa  67.8  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.17 
 
 		 824 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  42.05 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38.82 
 
 		 830 aa  57.8  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  33.04 
 
 		 466 aa  50.4  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  33.33 
 
 		 486 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  35.87 
 
 		 444 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  30.17 
 
 		 431 aa  41.6  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>