28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46170 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_46170  predicted protein  100 
 
 		 1069 aa  2194    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  34.18 
 
 		 645 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46243  predicted protein  28.07 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39253  predicted protein  30.32 
 
 		 1538 aa  74.3  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.85 
 
 		 674 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  26.55 
 
 		 1537 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  27.72 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.34 
 
 		 691 aa  72.4  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45068  predicted protein  28.32 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.94 
 
 		 824 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53961  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  34.44 
 
 		 668 aa  64.3  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.21 
 
 		 680 aa  63.9  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.7 
 
 		 609 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.17 
 
 		 830 aa  63.2  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.93 
 
 		 1672 aa  62.4  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46171  predicted protein  24.46 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  32.19 
 
 		 444 aa  60.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.58 
 
 		 449 aa  56.2  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  27.32 
 
 		 693 aa  55.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  25 
 
 		 651 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.66 
 
 		 486 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.18 
 
 		 682 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.58 
 
 		 680 aa  47  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.14 
 
 		 590 aa  46.2  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  27.85 
 
 		 404 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  26.29 
 
 		 706 aa  46.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  30.06 
 
 		 431 aa  46.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  25.14 
 
 		 587 aa  45.8  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>