43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6754 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6754  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  100 
 
 		 627 aa  1254    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0686  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.32 
 
 		 680 aa  275  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0892  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  36.98 
 
 		 682 aa  258  3e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1775  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.13 
 
 		 609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910823  normal  0.14038 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0596  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  37.03 
 
 		 680 aa  227  5.0000000000000005e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.056787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1230  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.06 
 
 		 680 aa  227  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.491664  normal  0.307013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1375  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  41 
 
 		 674 aa  226  7e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5100  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.93 
 
 		 548 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2122  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  34.73 
 
 		 590 aa  218  2e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.553057  normal  0.356017 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2403  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  37.86 
 
 		 659 aa  216  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000436928  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2123  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  35.53 
 
 		 587 aa  213  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.14818 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1931  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  38 
 
 		 684 aa  211  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0195615  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1865  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.1 
 
 		 575 aa  210  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5079  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.92 
 
 		 693 aa  200  5e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5142  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  35.93 
 
 		 529 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0225115  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2195  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  33.22 
 
 		 676 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.848428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 691 aa  178  3e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0582843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1530  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.92 
 
 		 1537 aa  159  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  30.15 
 
 		 706 aa  139  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0423  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  30.43 
 
 		 824 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.657056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.25 
 
 		 830 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5059  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  31.75 
 
 		 406 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.241627  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0261  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  29.72 
 
 		 486 aa  115  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.721342  normal  0.813855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1055  hypothetical protein  30.56 
 
 		 666 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00001121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0594  PKD domain-containing protein  29.07 
 
 		 466 aa  98.6  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0377  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.08 
 
 		 404 aa  94.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6514  hypothetical protein  27.89 
 
 		 651 aa  89  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1333  hypothetical protein  43.97 
 
 		 232 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5056  hypothetical protein  50.57 
 
 		 143 aa  83.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3525  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  28.06 
 
 		 1672 aa  82.4  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0044  PKD domain-containing protein  28.37 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2823  quinoprotein (ISS)  28.57 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2094  hypothetical protein  27.47 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0323  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.92 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0274075  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  26.94 
 
 		 645 aa  56.6  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  26.36 
 
 		 1437 aa  53.9  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2172  quinoprotein (ISS); K06485 integrin alpha 6  29.46 
 
 		 431 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  24.43 
 
 		 595 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  23.33 
 
 		 692 aa  48.9  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1383  EGF calcium-binding domain protein  48.21 
 
 		 387 aa  47.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8620  hypothetical protein  27.16 
 
 		 458 aa  47.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5749  hypothetical protein  37.25 
 
 		 432 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1391  EGF calcium-binding domain protein  38.81 
 
 		 428 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.510113  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>